Genomoviridae Familie von Einzelstrang-DNA -Viren im Phylum Cressdnaviricota Genom von etwa 2,2–2,4 kb (Kilobasen). Wie bei allen CRESS-DNA-Viren kodiert das Genom (unter anderen) für des Initiationsprotein Rep der Rolling-Circle-Replikation , sowie für familienspezifische Kapsidproteine .
In Rep-basierten Phylogenien bilden die Genomoviridae eine Schwesterklade zu dem Pflanzenviren der Familie Geminiviridae Ordnung Geplafuvirales .[ 3] [ 4] International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)Gattungen in dieser Familie anerkannt, darunter die Gattung Gemycircularvirus [ 1]
Der Familienname Genomoviridae ist ein Akronym , abgeleitet von ge minivirus-likeno movement protein viridae für Virusfamilien.
Der Gattungsname Gemycircularvirus steht für Ge mini-like my co-infecting circular virus [ 5] [ 6]
Die Der Referenzstamm Sklerotinia sclerotiorum hypovirulence associated DNA virus 1 (SsHADV-1) der Typusart Sclerotinia-Gemycircularvirus 1 Gemycircularvirus sclero1 ) der Gattung Gemycircularvirus ist derzeit (Stand 2016) das einzige kultivierte Mitglied der Familie.[ 3] Metagenomik -Techniken entdeckt.[ 4]
Beschreibung
Die Virionen (Virusteilchen) der Genomoviridae haben eine ikosaedrische Symmetrie mit Triangulationszahl T=1.
Genomkarte von SsHADV-1, Spezies Gemycircularvirus sclero1 . LIR/SIR=long/short intergenic region Genomkarte des vorgeschlagenen Mitglieds „Mosquito-associated virus Barbados Gemycircularvirus ; mit Haarnadelstruktur (Teil der LIR)[ 7] Die Genomoviridae -Virionen haben ein Genom der Länge von 2,1–2,2 kb (Kilobasen).
Es kodiert für zwei Proteine : neben dem Replikatorprotein Rep noch für ein Kapsidprotein CAP (oder CP).
Zwei intergenische Regionen (Zwischen-Gen-Regionen, intergenic regions ) trennen diese beiden Offene Leserahmen (open reading frames , ORFs): Die kürzere SIR und die längere LIR.
Die Transkription startet bidirektional von der langen intergenischen Region (LIR), die zwei divergente Promotoren enthält.
Die kurze intergenische Region enthält bidirektionale Polyadenylierungssignale .[ 8]
Das Rep-Protein hat eine gewisse Homologie mit dem Rep-Protein der Geminiviridae ; das CP-Protein hat im Gegensatz dazu keine bekannte Homologe.
Da SsHADV-1, ein Mykovirus (Pilzvirus), der bisher (s. o.) einzige kultivierte Vertreter ist, sind Pilze die die einzig nachgewiesenen natürlichen Wirte der Genomoviridae . Wenn Genomoviridae mit anderen Eukaryoten assoziiert (vergesellschaftet) sind, kann dies auch daran liegen, dass sie deren Symbionten parasitieren, nicht diese selbst. Für Viren aus der Metagenomik konnte bisher nur ein Einzelfällen ohne Isolierung ein vermutlicher Wirt (Biologie) vorgeschlagen werden.
Gattung Gemytripvirus
Genomorganisation der drei Segmente von FgGMTV1 (Gattung Gemytripvirus ). Der einzelne ORF jeder DNA-Komponente ist als dicker Pfeil dargestellt. Die Positionen der mutmaßlichen Haarnadelstruktur (stem loop ), Common Region Major (CR-M) und Common Region Stem-Loop (CR-SL, anstelle der LIR) sind angegeben.[ 2] Gemytripvirus fugra1 (veraltet Fusarium graminearum gemytripvirus 1 , FgGMTV1)[ 9] Fusarium graminearum CRESS-DNA-Viren -Architektur (Haarnadelstruktur , stem loop etc.). Das Replikations-Initiator-Protein (REP) dieser Viren wird auf Segment DNA-A kodiert , das Kapsidprotein (CP) auf DNA-B (der ORF p26 auf DNA-C hat keine offensichtlichen Ähnlichkeiten zu anderen bekannten Sequenzen). Man nimmt an, dass diese Viren sich aus Vorfahren der Genomoviridae mit dem üblichen unsegmentierten Genom entwickelt haben.[ 2] Klade wurde 2021 die Gattung Gemytripvirus eingerichtet.[ 1]
Systematik
Phylogenetischer Baum der Genomoviridae mit Vertreter „Mosquito-associated virus Barbados “ (MaVBRB)[ 7] Das ICTV hat mit Master Species List #39v3 (Stand Juni 2024) folgende Gattungen und Spezies in der Familie bestätigt,[ 10] [ 11]
Familie: Genomoviridae
Spezies Gemycircularvirus abati1 mit Genomoviridae sp. ctbi89
Spezies Gemycircularvirus alces1 mit Alces alces faeces associated genomovirus MP84
Spezies Gemycircularvirus alces2 mit Alces alces faeces associated genomovirus MP157
Spezies Gemycircularvirus ansal1 mit Genomoviridae sp. bif24cir1
Spezies Gemycircularvirus aspar1 mit Plant associated genomovirus 21
Spezies Gemycircularvirus austro1 mit Blackfly genomovirus 2
Spezies Gemycircularvirus austro2 mit Blackfly genomovirus 7
Spezies Gemycircularvirus austro3 mit Blackfly genomovirus 4
Spezies Gemycircularvirus austro4 mit Blackfly genomovirus 9
Spezies Gemycircularvirus austro5 mit Blackfly genomovirus 5
Spezies Gemycircularvirus austro6 mit Blackfly genomovirus 10
Spezies Gemycircularvirus bemta1 mit Bemisia-associated genomovirus AdO
Spezies Gemycircularvirus blabi1 mit Blackbird associated gemycircularvirus 1 (BlGCV1), Faecal-associated gemycircularvirus 1c
Spezies Gemycircularvirus bovas1 mit Bovine associated gemycircularvirus 1 (BoGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 22
Spezies Gemycircularvirus bromas1 mit Bromus associated gemycircularvirus 1 (BGCV1), Bromus-associated circular DNA virus 3
Spezies Gemycircularvirus canlup1 mit Lupine feces-associated gemycircularvirus 2
Spezies Gemycircularvirus cassa1 mit Cassava associated gemycircularvirus 1 (CaGCV1), Cassava associated cicular DNA virus
Spezies Gemycircularvirus chicas1 mit Chicken associated gemycircularvirus 1 (ChiGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 20
Spezies Gemycircularvirus chicas2 mit Chicken associated gemycircularvirus 2 (ChiGCV2),Faeces associated gemycircularvirus 17
Spezies Gemycircularvirus chickad1 mit Chickadee associated gemycircularvirus 1 (ChGCV1), Poecile atricapillus GI tract-associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus citas1 mit Citrus Tunisia genomovirus 2
Spezies Gemycircularvirus cybusi1 mit Spider associated circular virus 1
Spezies Gemycircularvirus denbre1 mit Bark beetle-associated genomovirus 1
Spezies Gemycircularvirus denbre2 mit Bark beetle-associated genomovirus 2
Spezies Gemycircularvirus denbre3 mit Bark beetle-associated genomovirus 3
Spezies Gemycircularvirus denbre4 mit Bark beetle-associated genomovirus 4
Spezies Gemycircularvirus denpo1 mit Bark beetle-associated genomovirus 5
Spezies Gemycircularvirus derva1 mit Tick-associated genomovirus 1
Spezies Gemycircularvirus dichism1 mit Plant associated genomovirus 19
Spezies Gemycircularvirus draga1 mit Dragonfly associated gemycircularvirus 1 (DGCV1), Dragonfly-associated circular virus 2
Spezies Gemycircularvirus echiam1 mit Thrips-associated genomovirus 1
Spezies Gemycircularvirus equas1 mit Equine associated gemycircularvirus 1 (EGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 18
Spezies Gemycircularvirus erati1 mit Giant house spider associated circular virus 1
Spezies Gemycircularvirus euhet1 mit Euphorbia heterophylla associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus furse1 mit Fur seal associated gemycircularvirus 1 (FSGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 4
Spezies Gemycircularvirus geras1 mit Gerygone associated gemycircularvirus 1 (GGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 6
Spezies Gemycircularvirus geras2 mit Gerygone associated gemycircularvirus 2 (GGCV2), Faeces associated gemycircularvirus 5
Spezies Gemycircularvirus geras3 mit Gerygone associated gemycircularvirus 3 (GGCV3),Faeces associated gemycircularvirus 3
Spezies Gemycircularvirus giapa1 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa2 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa3 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa4 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa5 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa6 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa7 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus giapa8 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus gopha1 mit Tortoise genomovirus 17
Spezies Gemycircularvirus gopha2 mit Tortoise genomovirus 10
Spezies Gemycircularvirus gopha3 mit Genomoviridae sp. ctjg823
Spezies Gemycircularvirus hadtis1 mit Genomoviridae sp. ctij207
Spezies Gemycircularvirus haeme1 mit Finch associated genomovirus 5
Spezies Gemycircularvirus haeme2 mit Finch associated genomovirus 6
Spezies Gemycircularvirus hydro1 mit Capybara genomovirus 1
Spezies Gemycircularvirus hypas1 mit Hypericum associated gemycircularvirus 1 (HGCV1), Hypericum japonicum associated circular DNA virus
Spezies Gemycircularvirus ixode1 mit Tick-associated genomovirus 3
Spezies Gemycircularvirus lamas1 mit Lama associated gemycircularvirus 1 (LGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 21
Spezies Gemycircularvirus lebec1 mit Plant associated genomovirus 20
Spezies Gemycircularvirus legle1 mit Plant associated genomovirus 15
Spezies Gemycircularvirus lepa2 mit Lynx canadensis faeces associated genomovirus CL1 46
Spezies Gemycircularvirus lepam1 mit Alces alces faeces associated genomovirus MP111
Spezies Gemycircularvirus lepam2 mit Alces alces faeces associated genomovirus MP43
Spezies Gemycircularvirus lepam3 mit Lepus americanus faeces associated genomovirus SHP9
Spezies Gemycircularvirus lynca1 mit Lynx canadensis faeces associated genomovirus CL1 48
Spezies Gemycircularvirus lynca2 mit Lynx canadensis faeces associated genomovirus CL1 71
Spezies Gemycircularvirus lynca3 mit Lynx canadensis faeces associated genomovirus CL5 48
Spezies Gemycircularvirus lynca4 mit Lynx canadensis faeces associated genomovirus CL1 148
Spezies Gemycircularvirus malas1 mit Mallard associated gemycircularvirus 1 (MGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 7
Spezies Gemycircularvirus minio1 mit Miniopterus associated gemycircularvirus 1 (BtGCV1), Miniopterus associated gemycircularvirus 1
Spezies Gemycircularvirus miniti1 mit Genomoviridae sp. cthi275
Spezies Gemycircularvirus miniti2 mit Genomoviridae sp. ctce776
Spezies Gemycircularvirus miniti3 mit Genomoviridae sp. ctbh806
Spezies Gemycircularvirus miniti4 mit Genomoviridae sp. ctjb817
Spezies Gemycircularvirus minti6 mit Genomoviridae sp. ctcj270
Spezies Gemycircularvirus mocha1 mit Momordica charantia associated gemycircularvirus
Spezies Gemycircularvirus monas1 mit Mongoose associated gemycircularvirus 1 (MGCV1), Mongoose feces-associated gemycircularvirus d
Spezies Gemycircularvirus mosqi1 mit Mosquito associated gemycircularvirus 1 (MoGCV1), Mosquito VEM virus SDBVL G
Spezies Gemycircularvirus mouti1 mit Genomoviridae sp. ctbd78
Spezies Gemycircularvirus mouti10 mit Genomoviridae sp. ctbf84
Spezies Gemycircularvirus mouti11 mit Genomoviridae sp. ctjj82
Spezies Gemycircularvirus mouti12 mit Genomoviridae sp. ctbh39
Spezies Gemycircularvirus mouti2 mit Genomoviridae sp. ctba76
Spezies Gemycircularvirus mouti3 mit Genomoviridae sp. ctgb66
Spezies Gemycircularvirus mouti4 mit Genomoviridae sp. ctda73
Spezies Gemycircularvirus mouti5 mit Genomoviridae sp. ctjh74
Spezies Gemycircularvirus mouti6 mit Genomoviridae sp. cted72
Spezies Gemycircularvirus mouti7 mit Genomoviridae sp. ctdb80
Spezies Gemycircularvirus mouti8 mit Genomoviridae sp. ctji71
Spezies Gemycircularvirus mouti9 mit Genomoviridae sp. ctca70
Spezies Gemycircularvirus odona1 mit Odonata associated gemycircularvirus 1 (OGCV1), Odonata associated gemycircularvirus-1
Spezies Gemycircularvirus odona2 mit Odonata associated gemycircularvirus 2 (OGCV2), Odonata associated gemycircularvirus-2
Spezies Gemycircularvirus oltre1 mit Olive associated gemycircularvirus 1
Spezies Gemycircularvirus opunt1 mit Plant associated genomovirus 25
Spezies Gemycircularvirus oxcor1 mit Oxalis corniculata genomoviridae
Spezies Gemycircularvirus pleca1 mit Gemycircularvirus sp. BS50/Hun/2013
Spezies Gemycircularvirus poass1 mit Poaceae associated gemycircularvirus 1 (PGCV1), Poaceae-associated gemycircularvirus 1
Spezies Gemycircularvirus porci1 mit Porcine associated gemycircularvirus 1 (PoGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 19
Spezies Gemycircularvirus porci2 mit Porcine associated gemycircularvirus 2 (PoGCV2), Faeces associated gemycircularvirus 2
Spezies Gemycircularvirus ptero1 mit Pteropus associated gemycircularvirus 1 (PtGCV1), mit Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-10
Spezies Gemycircularvirus ptero10 mit Pteropus associated gemycircularvirus 10 (PtGCV10)
Spezies Gemycircularvirus ptero2 mit Pteropus associated gemycircularvirus 2 (PtGCV2), Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-2
Spezies Gemycircularvirus ptero3 mit Pteropus associated gemycircularvirus 3 (PtGCV3)
Spezies Gemycircularvirus ptero4 mit Pteropus associated gemycircularvirus 4 (PtGCV4)
Spezies Gemycircularvirus ptero5 mit Pteropus associated gemycircularvirus 5 (PtGCV5)
Spezies Gemycircularvirus ptero6 mit Pteropus associated gemycircularvirus 6 (PtGCV6)
Spezies Gemycircularvirus ptero7 mit Pteropus associated gemycircularvirus 7 (PtGCV7)
Spezies Gemycircularvirus ptero8 mit Pteropus associated gemycircularvirus 8 (PtGCV8)
Spezies Gemycircularvirus ptero9 mit Pteropus associated gemycircularvirus 9 (PtGCV9)
Spezies Gemycircularvirus raski1 mit Genomoviridae sp. ctbb31
Spezies Gemycircularvirus ratas1 mit Rat associated gemycircularvirus 1 (RGCV1), Gemycircularvirus gemy-ch-rat1
Spezies Gemycircularvirus rebac1 mit Northern red-backed vole stool-associated gemycircularvirus 110
Spezies Gemycircularvirus recro1 mit Gemycircularvirus sp. yc-18
Spezies Gemycircularvirus sarpe1 mit Plant associated genomovirus 17
Spezies Gemycircularvirus sclero1 Sclerotinia gemycircularvirus 1 (SSHDV1), Sclerotinia sclerotiorum hypovirulence-associated DNA virus 1 [ 6] [ 5]
Spezies Gemycircularvirus sewopo1 mit Sewage derived gemycircularvirus 1 (SeGCV1)
Spezies Gemycircularvirus sewopo2 mit Sewage derived gemycircularvirus 2 (SeGCV2)
Spezies Gemycircularvirus sewopo3 mit Sewage derived gemycircularvirus 3 (SeGCV3), Sewage-associated gemycircularvirus 6
Spezies Gemycircularvirus sewopo4 mit Sewage derived gemycircularvirus 4 (SeGCV4), Sewage-associated gemycircularvirus-7b
Spezies Gemycircularvirus sewopo5 mit Sewage derived gemycircularvirus 5 (SeGCV5), Sewage-associated gemycircularvirus 9
Spezies Gemycircularvirus sheas1 mit Sheep associated gemycircularvirus 1 (ShGCV1), Faeces associated gemycircularvirus 16
Spezies Gemycircularvirus siedo1 mit Sierra dome spider associated circular virus 1
Spezies Gemycircularvirus solas1 mit Plant associated genomovirus 11
Spezies Gemycircularvirus soybe1 mit Soybean associated gemycircularvirus 1 (SoGCV1), Soybean leaf-associated gemycircularvirus 1
Spezies Gemycircularvirus termi1 mit Termite associated circular virus 2
Spezies Gemycircularvirus trilo1 mit Plant associated genomovirus 22
Spezies Gemycircularvirus turti1 mit Genomoviridae sp. ctcg63
Spezies Gemycircularvirus willde1 mit Plant associated genomovirus 13
Spezies „Mosquito-associated virus Barbados [ 7] Spezies Gemyduguivirus arteca1 mit Artemisia carvifolia genomoviridae
Spezies Gemyduguivirus austo1 mit Blackfly genomovirus 8
Spezies Gemyduguivirus bemta1 mit Bemisia-associated genomovirus AdDF
Spezies Gemyduguivirus draga1 (ehem. Typus) mit Dragonfly associated gemyduguivirus 1 (DGDV1), Dragonfly-associated circular virus 3
Spezies Gemyduguivirus hydro1 mit Capybara genomovirus 3
Spezies Gemyduguivirus hydro2 mit Capybara genomovirus 8
Spezies Gemyduguivirus hydro3 mit Capybara genomovirus 5
Spezies Gemyduguivirus macra1 mit Plant associated genomovirus 4
Spezies Gemyduguivirus merre1 mit Plant associated genomovirus 5
Spezies Gemyduguivirus minti1 mit Genomoviridae sp. ctcd252
Spezies Gemyduguivirus minti2 mit Genomoviridae sp. ctdb242
Spezies Gemyduguivirus recro1 mit Gemycircularvirus sp. yc-19 Spezies Gemygorvirus cania1 mit Canine associated gemygorvirus 1 (CGGV1) Faeces associated gemycircularvirus 15
Spezies Gemygorvirus hydro1 mit Capybara genomovirus 6
Spezies Gemygorvirus malas1 mit Mallard associated gemygorvirus 1 (MGGV1), Faeces associated gemycircularvirus 14 Meles meles fecal virus
Spezies Gemygorvirus opunt1 mit Plant associated genomovirus 26
Spezies Gemygorvirus poaspe1 mit Plant associated genomovirus 1
Spezies Gemygorvirus ptero1 mit Pteropus associated gemygorvirus 1 (PtGGV1), Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-1
Spezies Gemygorvirus sewopo1 mit Sewage derived gemygorvirus 1 (SeGGV1), Human genital-associated circular DNA virus-1 Sewage-associated gemycircularvirus 5
Spezies Gemygorvirus stara1 (ehem. Typus) mit Starling associated gemygorvirus 1 (StGGV1), Faeces associated gemycircularvirus 10 Spezies Gemykibivirus abati1 mit Genomoviridae sp. ctbb79
Spezies Gemykibivirus abati2 mit Genomoviridae sp. ctbi86
Spezies Gemykibivirus anima1 mit Porcine feces-associated gemycircularvirus
Spezies Gemykibivirus badas1 mit Badger associated gemykibivirus 1
Spezies Gemykibivirus bemta1 mit Bemisia-associated genomovirus NfO
Spezies Gemykibivirus blabi1 mit Blackbird associated gemykibivirus 1 (BbGKV1)
Spezies Gemykibivirus blaro1 mit Black robin associated gemykibivirus 1 (BRGKV1)
Spezies Gemykibivirus bovas1 mit Bovine associated gemykibivirus 1 (BGKB1), Dragonfly associated gemykibivirus 1
Spezies Gemykibivirus canfam1 mit Canine feces-associated gemycircularvirus
Spezies Gemykibivirus cowchi1 mit Cattle blood-associated gemycircularvirus
Spezies Gemykibivirus cybusi1 mit Cybaeus spider associated circular virus 2
Spezies Gemykibivirus cynas1 mit Plant associated genomovirus 3
Spezies Gemykibivirus draga1 mit Dragonfly associated gemykibivirus 1 (DGKB1)
Spezies Gemykibivirus echi1 mit Thrips-associated genomovirus 3
Spezies Gemykibivirus galga1 mit Chicken genomovirus mg7_73
Spezies Gemykibivirus galga2 mit Chicken genomovirus mg8_401
Spezies Gemykibivirus galga3 mit Chicken genomovirus mg4_1218
Spezies Gemykibivirus giapa1 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemykibivirus hadtis1 mit Genomoviridae sp. ctce205
Spezies Gemykibivirus haeme1 mit Finch associated genomovirus 3
Spezies Gemykibivirus haeme2 mit Gopherus associated genomovirus 1
Spezies Gemykibivirus haeme3 mit Finch associated genomovirus 2
Spezies Gemykibivirus haeme4 mit Finch associated genomovirus 4
Spezies Gemykibivirus haeme5 mit Finch associated genomovirus 1
Spezies Gemykibivirus hipla1 mit Bat gemycircularvirus
Spezies Gemykibivirus humas1 mit Human associated gemykibivirus 1 (HGKV1), MSSI2.225 virus Sewage-associated gemycircularvirus-10a Sewage-associated gemycircularvirus-10b
Spezies Gemykibivirus humas2 mit Human associated gemykibivirus 2 (HGKV2), Gemycircularvirus BZ1 Gemycircularvirus BZ2 Gemycircularvirus NP Gemycircularvirus SL1 Gemycircularvirus SL2 Gemycircularvirus SL3
Spezies Gemykibivirus humas3 mit Human associated gemykibivirus 3 Gemycircularvirus C1c Mongoose feces-associated gemycircularvirus c
Spezies Gemykibivirus humas4 mit Human associated gemykibivirus 4 Human gemycircularvirus GeTz1
Spezies Gemykibivirus humas5 mit Human associated gemykibivirus 5 (HGKV5), Gemycircularvirus HV-GcV2
Spezies Gemykibivirus hydro1 mit Capybara genomovirus 4
Spezies Gemykibivirus hydro2 mit Capybara genomovirus 2
Spezies Gemykibivirus hydro3 mit Capybara genomovirus 12
Spezies Gemykibivirus minti1 mit Genomoviridae sp. ctcg277
Spezies Gemykibivirus monas1 mit Mongoose associated gemykibivirus 1 (MGKV1), Mongoose feces-associated gemycircularvirus b
Spezies Gemykibivirus mouti1 mit Genomoviridae sp. ctba85
Spezies Gemykibivirus mouti2 mit Genomoviridae sp. ctci83
Spezies Gemykibivirus pitis1 mit Genomoviridae sp. ctbf8
Spezies Gemykibivirus pitis2 mit Genomoviridae sp. ctdb7
Spezies Gemykibivirus planta1 mit Plant associated genomovirus 2
Spezies Gemykibivirus planta2 mit Plant associated genomovirus 29
Spezies Gemykibivirus ptero1 mit Pteropus associated gemykibivirus 1 (PtGKV1), Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-12
Spezies Gemykibivirus raski1 mit Genomoviridae sp. ctbh29
Spezies Gemykibivirus rhina1 mit Rhinolophus associated gemykibivirus 1 (RGKV1), Mongoose feces-associated gemycircularvirus a
Spezies Gemykibivirus rhina2 mit Rhinolophus associated gemykibivirus 2 (RGKV2)
Spezies Gemykibivirus sewopo1 mit Sewage derived gemykibivirus 1 (SeGKV1), Sewage associated gemycircularvirus 3
Spezies Gemykibivirus sewopo2 mit Sewage derived gemykibivirus 2 (SEGKV1), Sewage-associated gemycircularvirus 2
Spezies Gemykibivirus turti1 mit Genomoviridae sp. cthd64
Spezies Gemykibivirus waste1 mit Genomoviridae sp. 6434_414
Spezies Gemykibivirus womot1 mit Genomoviridae sp. ctgi38 Spezies Gemykolovirus abati1 mit Genomoviridae sp. ctbe80
Spezies Gemykolovirus citas1 mit Citrus Tunisia genomovirus 1b
Spezies Gemykolovirus derva1 mit Tick-associated genomovirus 2
Spezies Gemykolovirus easlu1 mit Grasshopper associated circular virus 1
Spezies Gemykolovirus echia1 mit Thrips-associated genomovirus 4
Spezies Gemykolovirus gopha1 mit Tortoise genomovirus 9
Spezies Gemykolovirus gopha2 mit Tortoise genomovirus 13
Spezies Gemykolovirus hadtis1 mit Genomoviridae sp. ctce205
Spezies Gemykolovirus heris1 mit Plant associated genomovirus 7
Spezies Gemykolovirus lepam1 mit Alces alces faeces associated genomovirus MP68
Spezies Gemykolovirus poaspe1 mit Plant associated genomovirus 9
Spezies Gemykolovirus prupe1 mit Amygdalus persica genomoviridae
Spezies Gemykolovirus ptero1 (ehem. Typus) mit Pteropus associated gemykolovirus 1 (PtGKoV1), Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-6
Spezies Gemykolovirus ptero2 mit Pteropus associated gemykolovirus 2 (PtGKoV2), Pacific flying fox faeces associated gemycircularvirus-7
Spezies Gemykolovirus segpa1 mit Tubeweb spider associated circular virus 1
Spezies Gemykolovirus troti1 mit Genomoviridae sp. ctbi78 Spezies Gemykrogvirus abati1 mit Genomoviridae sp. ctea93
Spezies Gemykrogvirus apime1 mit Apis mellifera genomovirus 2
Spezies Gemykrogvirus bovas1 (ehem. Typus) mit Bovine associated gemykrogvirus 1 (BGKrV1), HCBI9.212 virus
Spezies Gemykrogvirus carib1 mit Caribou associated gemykrogvirus 1 (BGKrV1), Caribou feces-associated gemycircularvirus
Spezies Gemykrogvirus galga1 mit Chicken genomovirus mg4_1247
Spezies Gemykrogvirus galga2 mit Chicken stool-associated gemycircularvirus
Spezies Gemykrogvirus galga3 mit Chicken genomovirus mg4_1173
Spezies Gemykrogvirus galga4 mit Chicken genomovirus mg7_78
Spezies Gemykrogvirus galga5 mit Chicken genomovirus mg4_1165
Spezies Gemykrogvirus giapa1 mit Giant panda associated gemycircularvirus
Spezies Gemykrogvirus hadtis1 mit Genomoviridae sp. cthh214
Spezies Gemykrogvirus humas1 mit Gemycircularvirus sp. Viet Nam
Spezies Gemykrogvirus sewopo1 mit Sewage derived gemykrogvirus 1 (SeBKrV1), Sewage-associated gemycircularvirus 4 Spezies Gemykroznavirus anima1 mit Genomoviridae sp. ctda_5
Spezies Gemykroznavirus haeme1 mit Finch associated genomovirus 8
Spezies Gemykroznavirus hydro1 mit Capybara genomovirus 10
Spezies Gemykroznavirus poaspe1 mit Plant associated genomovirus 24
Spezies Gemykroznavirus rabas1 (ehem. Typus) mit Rabbit associated gemykroznavirus 1 , Faeces associated gemycircularvirus 11 (RBKroV1)
Spezies Gemykroznavirus solas1 mit Plant associated genomovirus 23
Spezies Gemykroznavirus zizan1 mit Zizania latifolia genomoviridae Spezies Gemytondvirus ostri1 (ehem. Typus) mit Ostrich associated gemytondvirus 1 (OGTV1), Faeces associated gemycircularvirus 12 Spezies Gemyvongvirus humas1 (ehem. Typus) mit Human associated gemyvongvirus 1 (HGVV1), Human plasma-associated gemycircularvirus
Spezies Gemyvongvirus minit1 mit Genomoviridae sp. ctcg218
Spezies Gemyvongvirus minit2 mit Genomoviridae sp. ctcj747 Gattung „Gemydayravirus “ ? (vermutet wegen Namensgebung der vorgeschlagenen Spezies)[ 12] Spezies „Botrytis gemydayravirus 1[ 12] [ 13]
Spezies „Botrytis gemydayravirus 2 “ – vorgeschlagen[ 14]
Einzelnachweise
↑ a b c d e f g ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 , New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
↑ a b c d e Pengfei Li, Shuangchao Wang, Lihang Zhang, Dewen Qiu, Xueping Zhou, Lihua Guo: A tripartite ssDNA mycovirus from a plant pathogenic fungus is infectious as cloned DNA and purified virions , in: Science Advances, Band 6, Nr. 14, 3. April 2020, eaay9634, doi:10.1126/sciadv.aay9634
↑ a b Mart Krupovic, Said A. Ghabrial, Daohong Jiang, Arvind Varsani: Genomoviridae: a new family of widespread single-stranded DNA viruses . In: Arch Virol . 161. Jahrgang, Nr. 9 , 2016, S. 2633–2643 , doi :10.1007/s00705-016-2943-3 PMID 27343045 .
↑ a b Arvind Varsani, Mart Krupovic: Sequence-based taxonomic framework for the classification of uncultured single-stranded DNA viruses of the family Genomoviridae . In: Virus Evolution . 3. Jahrgang, Nr. 1 , 2017, S. vew037 , doi :10.1093/ve/vew037 PMID 28458911 , PMC 5399927 (freier Volltext) – (oup.com ).
↑ a b Karyna Rosario, Anisha Dayaram, Milen Marinov, Jessica Ware, Simona Kraberger, Daisy Stainton, Mya Breitbart, Arvind Varsani: Diverse circular ssDNA viruses discovered in dragonflies (Odonata: Epiprocta) . In: J Gen Virol . 93. Jahrgang, Nr. 12 , 1. Dezember 2012, S. 2668–2681 , doi :10.1099/vir.0.045948-0 PMID 22915694 . mBio , insbes. Tbl. 2
↑ a b Xiao Yu, Bo Li, Yanping Fu, Daohong Jiang, Said A Ghabrial, Guoqing Li, Youliang Peng, Jiatao Xie, Jiasen Cheng, Junbin Huang, Xianhong Yi: A geminivirus-related DNA mycovirus that confers hypovirulence to a plant pathogenic fungus . In: Proc Natl Acad Sci USA . 107. Jahrgang, Nr. 18 , 4. Mai 2010, S. 8387–8392 , doi :10.1073/pnas.0913535107 PMID 20404139 , PMC 2889581 (freier Volltext). Epub 19. April 2010
↑ a b c
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