Die Phylogenie der CRESS-DNA-Viren zeigt (mit Stand April 2019) zwei große Kladen, von denen die erste die Familien Geminiviridae, Genomoviridae und die (bisher taxonomisch nicht erfasste) Gruppe der CRESSV6-Viren umfasst. Das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ist dem 2019er Vorschlag gefolgt und hat diese erste Klade als Ordnung Geplafuvirales offiziell bestätigt.[3]
Wie bei allen CRESS-DNA-Viren kodiert das Genom der Geplafuvirales für ein Replikations-Initiations-Protein (Rep oder REP) und ein Kapsidprotein (Cap, CAP oder CP).
Gemeinsames und kennzeichnendes Merkmal des REP der Geplafuvirales ist das sog. GRS-Motiv (en. Geminivirus Rep Sequence), das sich zwischen den Motiven II und III befindet und in der anderen Großklade der CRESS-DNA-Viren nicht vorkommt. Dieses Motiv ermöglicht vermutlich die räumliche Anordnung der Motive II und III im REP.[4][5][3]
Im Übrigen fehlt den Geminiviridae und Genomoviridae, nicht aber CRESSV6, der Argininfinger im Helikasemotiv.[3]
Etymologie
Die Namen der Klasse und Ordnung leiten sich entsprechend dem Vorschlag an das ICTV von 2019 wie folgt her:[3]
Repensiviricetes ist ein Portmanteau (Kofferwort), zusammengesetzt aus Rep-encoding single strand und der Endung -viricetes für Virusklassen.
Geplafuvirales ist zusammengesetzt aus ge- für Gemini-/Genomo-, pla- für Pflanzen (en. plants) und fu- für Pilze (lat. fungi), -virales ist die Endung für Virusordnungen.
Systematik
Ungewurzelter Phylogenetischer Baum der CRESS-DNA-Viren nach Kazlauskas, Varsani und Krupovic (2018, Supplement).[6] Der nach rechts unten zeigende Ast entspricht den Geplafuvirales.
Mit Stand Juni 2024 hat die Ordnung folgende Zusammensetzung:[7][8]
Familie Geplanaviridae (früher provisorisch CRESSV6-Viren, englischCRESSV6 viruses)[3] alias „CRESS6“ (Vorschlag, mit provisorischen Namen)[9][6][10]
Gattung Acciovirus
Gattung Aguamentivirus
Gattung Alohovirus
Gattung Aparevirus
Gattung Avadavirus
Gattung Densaugvirus
Gattung Diffindovirus
Gattung Engorgivirus
Gattung Episkevirus
Gattung Expellivirus
Gattung Impedivirus
Gattung Lumovirus
Gattung Oblivivirus
Gattung Patrovirus
Gattung Protegovirus
Gattung Riddikuvirus
Gattung Stupevirus
Gattung Wingardivirus
Familie „CRESS-Rec2“ (Vorschlag, mit provisorischem Namen)[6]
ohne Familienzuordnung
Gattung(?) „Nepavirus“ („Nepal gemini-like virus“, teilw. verschrieben als „Nimivirus“) – wahrscheinlich in eigener Familie neben Geminiviridae.[11][12][13]
↑
Tara E. Nash, Mary B. Dallas, Maria Ines Reyes, Gregory K. Buhrman, J. Trinidad Ascencio-Ibañez, Linda Hanley-Bowdoin: Functional analysis of a novel motif conserved across geminivirus Rep proteins. In: J Virol, Band 85, S. 1182–1192, PMID 21084480, PMC 3020519 (freier Volltext), doi:10.1128/JVI.02143-10 (englisch).
↑
Arvind Varsani, Mart Krupovic: Sequence-based taxonomic framework for the classification of uncultured single-stranded DNA viruses of the family Genomoviridae, in: Virus Evol. Band 3, Nr. 1, Januar 2017, vew037, doi:10.1093/ve/vew037, PMC 5399927 (freier Volltext), PMID 28458911 (englisch).
↑ abc
Hiroto Kaneko, Morgan Gaia, Rodrigo Hernández-Velázquez, Patrick Forterre, Curtis A. Suttle, Hiroyuki Ogata et al.: Eukaryotic virus composition can predict the efficiency of carbon export in the global ocean, in: iScience, Band 24, Nr. 1, 22. Januar 2021, 102002, doi: 10.1016/j.isci.2020.102002, PMC 7811142 (freier Volltext), PMID 33490910; siehe Fig. 1(C).
↑
Terry Fei Fan Ng, Rachel Marine, Chunlin Wang, Peter Simmonds, Beatrix Kapusinszky, Ladaporn Bodhidatta, Bamidele Soji Oderinde, K. Eric Wommack, Eric Delwart: High variety of known and new RNA and DNA viruses of diverse origins in untreated sewage. In: J Virol. Band 6, Nr. 2), 18. Oktober 2012, S. 12161–12175. doi:10.1128/JVI.00869-12 (englisch).
