Vaz Ferreira war von 1928 bis 1930 Rektor der Universidad de la República, der größten Universität Uruguays. Aus gesundheitlichen Gründen musste er sich von diesem Amt zurückziehen. 1935 wurde er jedoch erneut einstimmig zum Rektor gewählt und hatte diese Funktion bis 1941 inne.[1] In dieser Zeit kämpfte er offen für die Unabhängigkeit der Universität während der Diktatur Gabriel Terras. Seit der Gründung der Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educación 1945 bis 1949 war er auch Dekan dieser Fakultät. 1952 bis 1958 folgten zwei weitere Amtszeiten in dieser Position.
