HNRPU

HNRNPU
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1ZRJ
معرفات
أسماء بديلة	HNRNPU, HNRPU, SAF-A, U21.1, hnRNP U, SAFA, -AS1, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (scaffold attachment factor A), heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, antisense RNA 1, C1orf199, NCRNA00201, EIEE54, pp120, GRIP120, DEE54
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 602869 MGI: MGI:1858195 HomoloGene: 22991 GeneCards: 3192
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• nucleotide binding; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • telomerase RNA binding; • RNA binding; • RNA polymerase II complex binding; • TFIIH-class transcription factor complex binding; • ربط دي إن إي; • chromatin binding; • double-stranded DNA binding; • single-stranded DNA binding; • ‏GO:0001106 transcription corepressor activity; • double-stranded RNA binding; • single-stranded RNA binding; • mRNA 3'-UTR binding; • actin binding; • poly(A) binding; • snRNA binding; • poly(C) RNA binding; • chromatin DNA binding; • poly(G) binding; • pre-mRNA binding; • ribonucleoprotein complex binding; • ‏GO:0032403 protein-containing complex binding; • sequence-specific double-stranded DNA binding; • ATP binding; • identical protein binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II C-terminal domain binding; • promoter-specific chromatin binding; • ‏GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
مكونات خلوية	• CRD-mediated mRNA stability complex; • سيتوبلازم; • catalytic step 2 spliceosome; • غشاء; • بلازم نووي; • telomerase holoenzyme complex; • حبيبة رنا; • spliceosomal complex; • نواة; • ‏GO:0005578 نسيج بيني خارج الخلية; • nuclear chromosome; • cell surface; • مصفوفة نووية; • nuclear speck; • ‏GO:0009327 protein-containing complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex; • inactive sex chromosome; • ribonucleoprotein complex; • حيز حركي; • جسيم مركزي; • midbody; • mitotic spindle; • mitotic spindle midzone; • mitotic spindle microtubule; • قسيم مركزي; • spindle pole; • صبغي; • مركز تنظيم الأنيبيبات الدقيقة; • جهاز مغزلي; • هيكل خلوي; • dendrite cytoplasm;
عمليات حيوية	• CRD-mediated mRNA stabilization; • mRNA splicing, via spliceosome; • ‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 المعالجة; • negative regulation of telomere maintenance via telomerase; • عملية إيقاعية; • mRNA processing; • osteoblast differentiation; • تضفير الآر أن إيه; • RNA metabolic process; • ‏GO:1901313 positive regulation of gene expression; • circadian regulation of gene expression; • cardiac muscle cell development; • cellular response to dexamethasone stimulus; • ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • negative regulation of kinase activity; • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • mRNA stabilization; • maintenance of protein location in nucleus; • cellular response to glucocorticoid stimulus; • RNA localization to chromatin; • positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity; • positive regulation of stem cell proliferation; • regulation of mitotic cell cycle; • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني; • regulation of mitotic spindle assembly; • ‏GO:1903308، ‏GO:0001672، ‏GO:0010848، ‏GO:1902649 regulation of chromatin organization; • positive regulation of attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore; • protein localization to spindle microtubule; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • negative regulation of stem cell differentiation; • ‏GO:0031497، ‏GO:0006336، ‏GO:0034724، ‏GO:0001301، ‏GO:0007580، ‏GO:0034652، ‏GO:0010847 chromatin organization; • دورة الخلية; • نمو متعدد الخلايا; • تمايز خلوي; • انقسام خلوي; • positive regulation of brown fat cell differentiation; • dendritic transport of messenger ribonucleoprotein complex; • adaptive thermogenesis;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ; ; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q00839; Q5RI18
	Q8VEK3
	‏NM_004501، ‏NM_031844 NR_026778، ‏NM_004501، ‏NM_031844
	‏XM_017321672، ‏XM_017321673، ‏XM_017321674 NM_016805، ‏XM_017321672، ‏XM_017321673، ‏XM_017321674
	‏NP_114032 NP_004492، ‏NP_114032
	‏XP_036008205، ‏XP_036008206، ‏XP_036008208، ‏XP_036008210 NP_058085، ‏XP_036008205، ‏XP_036008206، ‏XP_036008208، ‏XP_036008210
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

HNRPU‏ (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين HNRPU في الإنسان.^[1]^[2]

الوظيفة

الأهمية السريرية

المراجع

^ Fackelmayer FO، Richter A (سبتمبر 1994). "Purification of two isoforms of hnRNP-U and characterization of their nucleic acid binding activity". Biochemistry. ج. 33 ع. 34: 10416–22. DOI:10.1021/bi00200a024. PMID:8068679.
^ Fackelmayer FO، Richter A (مارس 1994). "hnRNP-U/SAF-A is encoded by two differentially polyadenylated mRNAs in human cells". Biochim Biophys Acta. ج. 1217 ع. 2: 232–4. DOI:10.1016/0167-4781(94)90044-2. PMID:7509195.

قراءة متعمقة

Kiledjian M، Dreyfuss G (1992). "Primary structure and binding activity of the hnRNP U protein: binding RNA through RGG box". EMBO J. ج. 11 ع. 7: 2655–64. PMC:556741. PMID:1628625.
Barel M، Balbo M، Gauffre A، Frade R (1995). "Binding sites of the Epstein-Barr virus and C3d receptor (CR2, CD21) for its three intracellular ligands, the p53 anti-oncoprotein, the p68 calcium binding protein and the nuclear p120 ribonucleoprotein". Mol. Immunol. ج. 32 ع. 6: 389–97. DOI:10.1016/0161-5890(95)00005-Y. PMID:7753047.
Sidorenko SP، Law CL، Chandran KA، Clark EA (1995). "Human spleen tyrosine kinase p72Syk associates with the Src-family kinase p53/56Lyn and a 120-kDa phosphoprotein". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 92 ع. 2: 359–63. DOI:10.1073/pnas.92.2.359. PMC:42739. PMID:7831290.
Jordan P، Heid H، Kinzel V، Kübler D (1995). "Major cell surface-located protein substrates of an ecto-protein kinase are homologs of known nuclear proteins". Biochemistry. ج. 33 ع. 49: 14696–706. DOI:10.1021/bi00253a007. PMID:7993898.
Liu Q، Dreyfuss G (1996). "A novel nuclear structure containing the survival of motor neurons protein". EMBO J. ج. 15 ع. 14: 3555–65. PMC:451956. PMID:8670859.
Fujioka Y، Matozaki T، Noguchi T، Iwamatsu A، Yamao T، Takahashi N، Tsuda M، Takada T، Kasuga M (1997). "A novel membrane glycoprotein, SHPS-1, that binds the SH2-domain-containing protein tyrosine phosphatase SHP-2 in response to mitogens and cell adhesion". Mol. Cell. Biol. ج. 16 ع. 12: 6887–99. PMC:231692. PMID:8943344.
Dennehy KM، Broszeit R، Garnett D، Durrheim GA، Spruyt LL، Beyers AD (1997). "Thymocyte activation induces the association of phosphatidylinositol 3-kinase and pp120 with CD5". Eur. J. Immunol. ج. 27 ع. 3: 679–86. DOI:10.1002/eji.1830270316. PMID:9079809.
Malik KF، Jaffe H، Brady J، Young WS (1997). "The class III POU factor Brn-4 interacts with other class III POU factors and the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U." Brain Res. Mol. Brain Res. ج. 45 ع. 1: 99–107. DOI:10.1016/S0169-328X(96)00238-0. PMID:9105675.
Eggert M، Michel J، Schneider S، Bornfleth H، Baniahmad A، Fackelmayer FO، Schmidt S، Renkawitz R (1997). "The glucocorticoid receptor is associated with the RNA-binding nuclear matrix protein hnRNP U.". J. Biol. Chem. ج. 272 ع. 45: 28471–8. DOI:10.1074/jbc.272.45.28471. PMID:9353307.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Göhring F، Schwab BL، Nicotera P، Leist M، Fackelmayer FO (1998). "The novel SAR-binding domain of scaffold attachment factor A (SAF-A) is a target in apoptotic nuclear breakdown". EMBO J. ج. 16 ع. 24: 7361–71. DOI:10.1093/emboj/16.24.7361. PMC:1170336. PMID:9405365.
Hahm B، Cho OH، Kim JE، Kim YK، Kim JH، Oh YL، Jang SK (1998). "Polypyrimidine tract-binding protein interacts with HnRNP L.". FEBS Lett. ج. 425 ع. 3: 401–6. DOI:10.1016/S0014-5793(98)00269-5. PMID:9563502.
Matsui M، Breau WC، Iwasaki S، Hagiwara S، Tamai Y، Mori C، Bloom ML، Jerry MB، Eddy EM، Taketo MM (1999). "Retrovirus integration site Mintb encoding the mouse homolog of hnRNP U.". J. Biochem. ج. 125 ع. 6: 1104–14. DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022392. PMID:10348913.
Kim MK، Nikodem VM (2000). "hnRNP U inhibits carboxy-terminal domain phosphorylation by TFIIH and represses RNA polymerase II elongation". Mol. Cell. Biol. ج. 19 ع. 10: 6833–44. PMC:84680. PMID:10490622.
Kipp M، Schwab BL، Przybylski M، Nicotera P، Fackelmayer FO (2000). "Apoptotic cleavage of scaffold attachment factor A (SAF-A) by caspase-3 occurs at a noncanonical cleavage site". J. Biol. Chem. ج. 275 ع. 7: 5031–6. DOI:10.1074/jbc.275.7.5031. PMID:10671544.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Husi H، Ward MA، Choudhary JS، Blackstock WP، Grant SG (2000). "Proteomic analysis of NMDA receptor-adhesion protein signaling complexes". Nat. Neurosci. ج. 3 ع. 7: 661–9. DOI:10.1038/76615. PMID:10862698.
Taniura H، Yoshikawa K (2002). "Necdin interacts with the ribonucleoprotein hnRNP U in the nuclear matrix". J. Cell. Biochem. ج. 84 ع. 3: 545–55. DOI:10.1002/jcb.10047. PMID:11813259.
Lee J، Bedford MT (2002). "PABP1 identified as an arginine methyltransferase substrate using high-density protein arrays". EMBO Rep. ج. 3 ع. 3: 268–73. DOI:10.1093/embo-reports/kvf052. PMC:1084016. PMID:11850402.
Davis M، Hatzubai A، Andersen JS، Ben-Shushan E، Fisher GZ، Yaron A، Bauskin A، Mercurio F، Mann M، Ben-Neriah Y (2002). "Pseudosubstrate regulation of the SCF(beta-TrCP) ubiquitin ligase by hnRNP-U". Genes Dev. ج. 16 ع. 4: 439–51. DOI:10.1101/gad.218702. PMC:155337. PMID:11850407.