Nama Vaxholm berasal dari Kastil Vaxholm, yang dibangun pada tahun 1549 di sebuah pulau kecil yang lalu dikenakan ke cerukan, untuk tujuan pertahanan, oleh Raja Gustav Vasa.[butuh rujukan]
Kota Vaxholm didirikan pada tahun 1558, saat Raja Gustav Vasa membeli beberapa pertanian dari Pangeran Per Brahe. Kemudian daerah ini menerima hak kota sebagai kota dagang (köping) dan pada tahun 1652 dianugerahi Piagam Kerajaan. Lambang yang dirancang mengingatkan pada kubu dan industri perkapalan.[butuh rujukan]
Selama abad ke-19, kota ini berkembang. Pada tahun 1880-an, kota ini menjadi kota spa terkenal, dan banyak rumah musim panas dari kayu dibangun oleh orang-orang Stockholm.[butuh rujukan]
Tak sampai 1912 izin membangun rumah dari bahan selain kayu diizinkan, memberi kota ini sifat yang berbeda.[butuh rujukan]
