Otto III (Juni/Juli 980 – 23 Januari 1002) adalah Kaisar Romawi Suci dari 996 sampai kematian awalnya pada 1002. Sebagai seorang anggota dari dinasti Ottonian, Otto III adalah anak tunggal dari Kaisar Otto II dan istrinya Teofanu.
Otto III dimahkotai sebagai Raja Jerman pada 983 pada usia tiga tahun, tak lama setelah ayahnya meninggal di selatan Italia saat berkampanye melawan Kekaisaran Bizantium dan Keamiran Sisilia.