Museum ini juga menampung koleksi seni rupa, termasuk karya-karya seniman besar Amerika yang tinggal atau bekerja di daerah New Bedford, seperti Albert Bierstadt, William Bradford, dan Albert Pinkham Ryder, serta koleksi seni dekoratif produksi lokal, barang pecah belah, dan perabotan yang terkait dengan kebangkitan kota New Bedford sebagai pelabuhan perburuan paus di abad ke-19.
Gedung Bourne di museum ini menampung Lagoda, model kapal perburuan paus dengan skala setengah dari aslinya, dibuat pada tahun 1916 dan merupakan model kapal penangkap paus terbesar di dunia.