Desa Nalbessy terletak sekitar 4 kilometer dari Desa Leksula dan 22 km dari Namrole. Topografi Desa Nalbessy bervariasi, dari dataran hingga pegunungan dengan kemiringan di atas 15%. Desa Nalbessy berada pada ketinggian 5–600 m dpl.
Tekstur tanah di Nalbessy bervariasi, dari jenis tanah aluvial dengan tekstur liat berlempung pasir hingga tanah podsolik merah kuning di dataran tinggi dengan pH berkisar 5,5-7,5.
