Pada tahun 2022, jumlah penduduk kecamatan Malinau Selatan sebanyak 5.682 jiwa, dengan kepadatan penduduk 5 jiwa/km².[2] Kemudian, persentasi penduduk kecamatan ini berdasarkan agama yang dianut, hampir seluruhnya beragama Kekristenan yakni 81,54%, dengan rincian Protestan sebanyak 70,99% dan Katolik sebanyak 10,55%, umumnya dianut oleh Dayak (Kenyah, Lundayeh, Murut, Tajol, Kayan, Penan, Punan). Sebagian lainnya menganut agama Islam yakni 18,40%, dan sebagian kecil beragama Hindu 0,04% dan Buddha 0,02%.[4] Dan untuk sarana rumah ibadah, terdapat 9 gereja Protestan.[2]
