* Penampilan dan gol di klub senior hanya dihitung dari liga domestik dan akurat per 16 Mei 2021 (UTC) ‡ Penampilan dan gol di tim nasional akurat per 6 Juni 2021 (UTC)
Ochoa membuat debut profesional tingkat seniornya untuk Club América pada tahun 2004 dalam pertandingan liga Meksiko melawan Monterrey. Ia memenangkan gelar liga pertamanya pada tahun 2005 dan menjadi penjaga gawang pilihan pertama klub hingga 2011, membuat lebih dari 200 penampilan untuk América. Pada musim panas 2011, Ochoa bergabung dengan Ajaccio di Prancis.[5] Ia menghabiskan tiga musim bersama klub sampai mereka terdegradasi dari Ligue 1. Pada tahun 2014, Ochoa bergabung dengan Málaga tetapi gagal mendapatkan tempat utama di tim. Pada Juli 2016, ia bergabung dengan Granada dengan status pinjaman selama satu musim. Pada Juli 2017, ia bergabung dengan Standard Liège.