Kecamatan Aru Tengah Timur menurut astronomi terletak pada 5°57’ sampai dengan 6°28' Lintang Selatan dan dari 134°45' sampai dengan 136°30' Bujur Timur.
Adapun batas-batas Kecamatan Aru Tengah Timur adalah sebagai berikut:
Utara
Kecamatan Aru Utara
Timur
Provinsi Papua
Selatan
Kecamatan Aru Tengah Selatan
Barat
Kecamatan Aru Tengah
Topografi
Secara topografi Kecamatan Aru Tengah Timur berupa dataran rendah dan berawa-rawa yang memiliki luas ± 659,75 Km2 yang terletak pada ketinggian 0 - 5 mdpl.
Tidak terdapat gunung dan sungai yang mengalir secara terus-menerus sepanjang tahun di Kecamatan Aru Tengah Timur.
Geologi
Sebagian besar kecamatan Aru Tengah Timur berada pada 1 pulau besar, yaitu Pulau Kobroor, sebagian yang lain terletak di beberapa pulau - pulau kecil, seperti Pulau Mariri, Pulau Lear, dan lain lain.
Secara morfologi di sepanjang Pulau Kobroor, bertopografi karst terbentuk oleh batu gamping dan napal dengan puncak tertinggi sekitar 5 mdpl.
Menurut peta Geologi Indonesia [1965], pulau/kepulauan di Kecamatan Aru Tengah Timur terbentuk/tersusun dari tanah dan batuan yang tercatat 2 jenis tanah dan 6 jenis batuan, secara lengkap dapat dilihat pada Tabel 1.2.
Iklim
Iklim dipengaruhi oleh Laut Banda, Laut Arafura dan Samudra Indonesia juga dibayangi oleh Pulau Papua di Bagian Timur dan Benua Australia di Bagian Selatan, sehingga sewaktu-waktu terjadi perubahan.
Berdasarkan klasifikasi Agroklimate menurut OLDEMAN, IRSAL dan MULADI [1981], Kecamatan Aru Tengah Timur termasuk dalam Zone C2 dengan jumlah bulan basah 5 - 6 bulan dan bulan kering 2 - 3 bulan .
Pada keadaan musim teratur, Musim Timur berlangsung dari Bulan April sampai Oktober. Ini adalah Musim Kemarau. Musim Barat berlangsung dari Bulan Oktober sampai Februari. Musim hujan pada Bulan Desember sampai Februari dan curah hujan terbesar terjadi pada Bulan Desember dan Februari. Musim Pancaroba berlangsung di sepanjang bulan Maret/April dan Oktober/November. Bulan April sampai Oktober, bertiup Angin Timur Tenggara. Angin kencang bertiup pada Bulan Januari dan Februari diikuti dengan hujan deras dan laut bergelora. Bulan April sampai September bertiup Angin Timur, Tenggara dan Selatan sebanyak 91 persen dengan Angin Tenggara dominan 61 persen. Bulan Oktober sampai Maret bertiup Angin Barat Laut sebanyak 50 persen dengan Angin Barat Laut dominan 28 persen.