zh %E7%BE%A4%E7%89%B9%E5%BC%82%E6%80%A7%E6%8A%97%E5%8E%9F

現有可用的蛋白結構：
Pfam	結構（旧版） / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英语：PDBsum）	結構概要

泡沫病毒Gag蛋白
泡沫病毒Gag蛋白
鑑定
標誌	Gag_spuma
Pfam	PF03276（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR004957
Pfam
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群特异性抗原（Gag）
标识
生物	HIV-1 M:B_HXB2R
符号	gag
UniProt	P04591
其他数据

群特异性抗原（英语：Group-specific antigen，缩写：Gag）是包含逆转录病毒目（花椰菜病毒科除外）核心结构蛋白的多聚蛋白质。之所以这样命名，是因为科学家曾经认为它具有抗原性。现在知道是它构成了内壳，而不是暴露在外面的外壳。它构成了病毒构象的所有结构单元，并为成熟的病毒粒子提供支持框架。

所有正逆转录病毒Gag蛋白都被蛋白酶加工成MA（基质）、CA（衣壳）、NC（核衣壳）部分，有时甚至更多。^[1]如果Gag无法切割成其亚基，则病毒体无法成熟并保持无感染性。

它包含部分Gag-onc融合蛋白。

在HIV里的Gag

编号系统

HIV基因组是根据HIV-1 M组B亚型参考毒株HXB2进行编号的。^[2]

转录和mRNA加工

病毒进入靶细胞后，病毒基因组被整合到宿主细胞的染色质中。接着，RNA聚合酶II转录9181核苷酸全长病毒RNA。HIV Gag蛋白由HIV Gag基因编码，HXB2核苷酸790-2292。^[2]

MA（基质，Matrix protein）

HIV p17基质蛋白（MA）是一种17kDa的蛋白质，由132个氨基酸组成，包含Gag多聚蛋白质的N末端。它负责通过其高碱性区域（HBR）与磷脂酰肌醇二磷酸（PI(4,5)P2）产生相互作用，将Gag多聚蛋白质靶向细胞膜。^[3]HIV MA还与组装病毒中的HIV跨膜糖蛋白 Gp41接触。的确，它可能在将包膜糖蛋白募集到病毒出芽位点方面发挥关键作用。^{[來源請求]}

一旦Gag在核糖体上被翻译，Gag多聚蛋白质就会被N-肉豆蔻酰转移酶1在其N末端甘氨酸残基上进行豆蔻酰化。这是细胞膜靶向的关键修改。在膜未结合形式中，MA肉豆蔻酰脂肪酸尾被隔离在MA蛋白核心的疏水口袋中。^[3]

MA HBR对细胞膜PI(4,5)P2的识别激活了“肉豆蔻酰开关”，其中肉豆蔻酰基从MA疏水口袋中挤出并嵌入细胞膜中。^[3]与肉豆蔻酰开关激活平行（或可能伴随），PI(4,5)P2的花生四烯酸部分从细胞膜中提取并结合在MA表面的通道中（这与之前被MA肉豆蔻酰基团占据的通道不同）。^[3]

然后，HIV Gag通过三种相互作用紧密结合到膜表面：

在MA HBR和PI(4,5)P2磷酸肌醇之间，
在MA挤出的肉豆蔻酰尾和细胞膜的疏水内部之间，
在PI(4,5)P2花生四烯酸部分和沿着MA表面的疏水通道之间。^{[來源請求]}

CA（衣壳，Capsid）

P24衣壳蛋白（CA）是一种24kDa的蛋白质，融合到未加工的HIV Gag多聚蛋白质中MA的C末端。病毒成熟后，CA会形成病毒衣壳。CA有两个公认的结构域，即C端结构域（C-terminal domain）和N端结构域（N-terminal domain）。CA C端结构域和N端结构域在HIV出芽和衣壳结构中具有不同的作用。^{[來源請求]}

当使用西方墨点法检测HIV感染时，p24是测试的三种主要蛋白质之一，另外还有Gp120和Gp41。

虽然MA、IN、VPR和cPPT之前曾被认为是影响HIV靶向非分裂细胞能力的因素，但CA已被证明是非分裂细胞中逆转录病毒感染性的主要决定因素，这对于帮助避免基因治疗中的慢病毒载体的插入式突变。^[4]

SP1（间隔肽1，Spacer peptide 1）

间隔肽1（SP1）是一种介于CA和NC之间的14氨基酸多肽。CA-SP1连接处的切割是病毒成熟的最后一步，它允许CA凝结成病毒衣壳。SP1在溶液中是非结构化的，但在极性较低的溶剂或高多肽浓度下，它变成α螺旋结构。^[5]在科学研究中，CA（24kDa）的蛋白质印迹可以通过25kDa条带（未切割的CA-SP1）的高相对存在来指示成熟缺陷。SP1在HIV粒子组装中起着关键作用，^[5]尽管其作用的确切性质和SP1结构动力学的生理相关性尚不清楚。

NC（核衣壳，Necleocapsid）

HIV核衣壳蛋白（NC）是Gag多聚蛋白质中的7kDa锌指蛋白，在病毒成熟后形成病毒核衣壳。NC将全长病毒基因组RNA募集到新生病毒颗粒中。^{[來源請求]}

SP2（间隔肽2，Spacer peptide 2）

间隔肽2（SP2）是一种功能未知的16氨基酸多肽，可分隔Gag蛋白NC和p6。

P6

HIV P6是位于Gag多聚蛋白质C端的6kDa多肽。^[6]它募集细胞蛋白肿瘤易感基因101（运输所需的内体分选复合物-1的一个组成部分）和ALIX蛋白以启动病毒颗粒从细胞膜出芽。P6在成熟病毒中没有已知功能。^{[來源請求]}

在内源性逆转录病毒中

人内源性逆转录病毒K和人内源性逆转录病毒W拷贝里都携带广泛表达的Gag基因，这些基因通常都是受损的。推测它们与多发性硬化症和其他神经系统疾病有关的历史由来已久。^[7]

在其他病毒中

泡沫逆转录病毒亚科（例如UniProt P14349）和转座病毒科（例如UniProt Q86TG7）的Gag基因只有一个可识别的核壳部分。它还缺少豆蔻酰化序列。^[8]

泡沫逆转录病毒Gag与正逆转录病毒Gag相关，经结构研究表明，N端结构域的一部分与典型的衣壳蛋白具有功能和结构同源性。^[9]泡沫逆转录病毒Gag不像正逆转录病毒Gag那样处理，只需要在C端进行微小的3kDa切割，其他切割位点通常效率低下。^[10]

转座病毒Gag也是已知具有结构上同源的衣壳蛋白。每个衣壳由540种蛋白质组装而成。与正逆转录病毒CA蛋白不同，它不需要显着成熟。^[11]动物活性调节的细胞骨架相关蛋白（ARC）基因是从转座病毒属Gag中重新利用的。^[12]该基因负责在神经细胞之间转运mRNA，这是神经可塑性的关键部分。它独立出现在四足动物和果蝇中。^[13]

花椰菜病毒科成员很少对其包含衣壳的ORF进行Gag分配，但CP-PRO-POL布局确实显示了与规范的Gag-Pol设置的类比。这些部分是否粘在一起形成多聚蛋白质取决于花椰菜病毒科的属。^{[來源請求]}

参见

逆转录病毒通读元件

参考文献

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外部链接

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群特异性抗原