北方墨點法

北方墨點法（英語：Northern blot），又称 RNA 印迹法，是分子生物学、生物化学中常用的实验方法，通過探測樣品中的RNA（或隔离的mRNA）来研究基因表达。[1][2]

通过北方墨點法来检测RNA的流程图

利用探針偵測由凝膠電泳分離出來的RNA片段，尋找含有特定序列的RNA片段。與南方墨點法相似，RNA樣品經過凝膠電泳後會按照大小分離，然後將樣品從凝膠轉印到膜上，並用與目標序列互補的標記的探針來探測。實驗結果可以根據所用探針的不同，以多種方式來觀察，但大多數都顯示的是樣品中被探測的RNA條帶的相對位置，也就是分子大小；而條帶的強度則與樣品中目標RNA的含量相關。這一方法可以測量目標RNA在不同樣品中的情況，因此已經被普遍用於研究特定基因在生物體中表現的時刻和表現量，也是這類研究中最基本的手段。

發明者是史丹佛大學的James Alwine和喬治·斯塔克（George Stark）在1977年發明，其名字是源於第一種墨點技術，南方墨點法（命名者為Edwin Southern）[1]，兩者很相似，與南方墨點法主要的不同是北方墨點法探測的是RNA分子，而不是DNA分子。[3]

原理

與南方墨點法相似，膠體可以選用瓊脂凝膠或是聚丙烯醯胺凝膠，被檢測物是RNA，「探針」(probe)是與目標序列互補的RNA、DNA序列或是寡核苷酸，但是探針至少要有25個鹼基對與目標序列互補。

Capillary blotting system setup for the transfer of RNA from an electrophoresis gel to a blotting membrane.

膠體

RNA樣品通常以含甲醛的瓊脂凝膠電泳來分離，甲醛作為RNA變性劑，將RNA的二級結構變性成一級結構。凝膠內用溴化乙錠(EtBr)染色，可在UV光下觀察到RNA樣品的品質、大小。

實驗步驟

實驗大至分為鑄膠、跑膠、轉漬、北方雜合反應等幾個部分。

參見

• 南方墨點法
• 西方墨點法

参考文献

1. Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J. Raff, M., Roberts, K., Walter, P. 2008. Molecular Biology of the Cell, 5th ed. Garland Science, Taylor & Francis Group, NY, pp 538–539.
2. Kevil, C. G., Walsh, L., Laroux, F. S., Kalogeris, T., Grisham, M. B., Alexander, J. S. (1997) An Improved, Rapid Northern Protocol. Biochem. and Biophys. Research Comm. 238:277–279.
3. Bor, Y.C.; Swartz, J.; Li, Y.; Coyle, J.; Rekosh, D.; Hammarskjold, Marie-Louise. Northern Blot analysis of mRNA from mammalian polyribosomes. Nature Protocols. 2006. doi:10.1038/nprot.2006.216. 

外部链接

• （英文）OpenWetWare（页面存档备份，存于互联网档案馆）