Các đội tại mỗi bảng thi đấu theo thể thức vòng tròn hai lượt đi và về (sân nhà và sân đối phương) để tính điểm xếp hạng, chọn 4 đội vào thi đấu ở vòng chung kết gồm: 3 đội xếp thứ nhất ở mỗi bảng và 1 đội xếp thứ nhì có điểm và chỉ số cao hơn tại ba bảng. Hai đội xếp thứ sáu tại ba bảng mà có điểm, chỉ số phụ thấp hơn sẽ xuống hạng.
Tại vòng chung kết, 4 đội bắt cặp thi đấu loại trực tiếp một trận. 2 đội thắng sẽ thi đấu trận chung kết và được quyền thi đấu ở giải bóng đá hạng Nhất Quốc gia năm 2012.
Các đội tham dự
18 đội bóng tham dự giải Hạng nhì Quốc gia 2011 gồm:
1 đội bóng hạng Nhất năm 2010 xuống thi đấu ở hạng Nhì: Tiền Giang
14 đội hạng Nhì năm 2010: Bình Thuận, Cà Mau, Công an Nhân dân, DIC Bà Rịa Vũng Tàu, Dược Sài Gòn, ĐăkLăk, Hà Tĩnh, Lâm Đồng, Megastar United, Ngói Đồng Tâm Long An, Phađin Quảng Ngãi, Trẻ SHB Đà Nẵng [3], T&T V&V, Tôn Phương Nam TP Hồ Chí Minh.
3 đội bóng hạng Ba năm 2010 được lên thi đấu ở hạng Nhì năm 2011: Phú Yên, Bình Phước, FC Thống Nhất 08.
18 đội bóng được chia làm ba bảng theo khu vực địa lý và đăng ký sân thi đấu của các đội, cụ thể như sau:
Bảng A: Công an Nhân dân, Đăklăk, Hà Tĩnh, Megastar United, PhaĐin Quảng Ngãi và Trẻ SHB Đà Nẵng.
Bảng B: Bình Thuận, DIC Bà Rịa Vũng Tàu, Phú Yên, T&T V&V, Xổ số kiến thiết Đà Lạt - Lâm Đồng, và một trong số ba đội bóng trên địa bàn Tp Hồ Chí Minh (Dược Sài Gòn, FC Thống Nhất 08, Tôn Phương Nam TPHCM)
Bảng C: Bình Phước, Cà Mau, Ngói Đồng Tâm Long An, Tiền Giang và hai trong số ba đội bóng trên địa bàn Tp Hồ Chí Minh (Dược Sài Gòn, FC Thống Nhất 08, Tôn Phương Nam TPHCM).[4]