Dưới đây là thông tin chi tiết về các trận đấu trong khuôn khổ vòng đấu loại trực tiếp - Giải vô địch bóng đá thế giới 2006, diễn ra từ ngày 24 tháng 6 cho đến ngày 9 tháng 7 năm 2006. Hai đội đứng đầu của mỗi bảng (tổng cộng 16 đội) giành quyền tham gia vòng này. Trong vòng đấu loại trực tiếp (kể cả trận chung kết), nếu tỷ số hoà vào cuối phút 90 thì sẽ tiếp tục đá trong hai hiệp phụ (mỗi hiệp dài 15 phút không có nghỉ giữa giờ). Nếu tỷ số sau hai hiệp phụ vẫn hòa thì trận đấu được kết thúc bằng đá luân lưu 11m.
Trợ lý trọng tài: Víctoriano Giráldez Carrasco (Tây Ban Nha)
Pedro Medina Hernández (Tây Ban Nha)
Trọng tài thứ tư: Éric Poulat (Pháp)
Trọng tài thứ năm: Lionel Dagorne (Pháp)
Trợ lý trọng tài: Víctoriano Giráldez Carrasco (Tây Ban Nha)
Pedro Medina Hernández (Tây Ban Nha)
Trọng tài thứ tư: Mark Shield (Úc)
Trọng tài thứ năm: Ben Wilson (Úc)