LAMA5

LAMA5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Y38
Ідентифікатори
Символи	LAMA5, Laminin, alpha 5, laminin subunit alpha 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601033 MGI: 105382 HomoloGene: 4060 GeneCards: LAMA5
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity • integrin binding • signaling receptor binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • laminin-5 complex • extracellular region • базальна мембрана • laminin-10 complex • laminin-11 complex • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • synaptic cleft • neuromuscular junction • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • hair follicle development • диференціація клітин • regulation of embryonic development • regulation of cell migration • cell recognition • embryo development • lung development • muscle organ development • extracellular matrix organization • morphogenesis of a polarized epithelium • odontogenesis of dentin-containing tooth • focal adhesion assembly • branching involved in ureteric bud morphogenesis • regulation of cell adhesion • адгезія клітин • regulation of cell population proliferation • cytoskeleton organization • Ангіогенез • neural crest cell migration • animal organ morphogenesis • integrin-mediated signaling pathway • endothelial cell differentiation • substrate adhesion-dependent cell spreading • morphogenesis of embryonic epithelium • проліферація • cell migration • branching morphogenesis of an epithelial tube • branching involved in salivary gland morphogenesis • cilium assembly • protein localization to plasma membrane • cytokine-mediated signaling pathway • гістогенез • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3911	16776
Ensembl	ENSG00000130702	ENSMUSG00000015647
UniProt	O15230	Q61001
RefSeq (мРНК)	NM_005560	NM_001081171
RefSeq (білок)	NP_005551	NP_001074640
Локус (UCSC)	Хр. 20: 62.31 – 62.37 Mb	Хр. 2: 179.82 – 179.87 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LAMA5 (англ. Laminin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 695 амінокислот, а молекулярна маса — 399 737[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKRLCAGSA		LCVRGPRGPA		PLLLVGLALL		GAARAREEAG		GGFSLHPPYF
NLAEGARIAA		SATCGEEAPA		RGSPRPTEDL		YCKLVGGPVA		GGDPNQTIRG
QYCDICTAAN		SNKAHPASNA		IDGTERWWQS		PPLSRGLEYN		EVNVTLDLGQ
VFHVAYVLIK		FANSPRPDLW		VLERSMDFGR		TYQPWQFFAS		SKRDCLERFG
PQTLERITRD		DAAICTTEYS		RIVPLENGEI		VVSLVNGRPG		AMNFSYSPLL
REFTKATNVR		LRFLRTNTLL		GHLMGKALRD		PTVTRRYYYS		IKDISIGGRC
VCHGHADACD		AKDPTDPFRL		QCTCQHNTCG		GTCDRCCPGF		NQQPWKPATA
NSANECQSCN		CYGHATDCYY		DPEVDRRRAS		QSLDGTYQGG		GVCIDCQHHT
TGVNCERCLP		GFYRSPNHPL		DSPHVCRRCN		CESDFTDGTC		EDLTGRCYCR
PNFSGERCDV		CAEGFTGFPS		CYPTPSSSND		TREQVLPAGQ		IVNCDCSAAG
TQGNACRKDP		RVGRCLCKPN		FQGTHCELCA		PGFYGPGCQP		CQCSSPGVAD
DRCDPDTGQC		RCRVGFEGAT		CDRCAPGYFH		FPLCQLCGCS		PAGTLPEGCD
EAGRCLCQPE		FAGPHCDRCR		PGYHGFPNCQ		ACTCDPRGAL		DQLCGAGGLC
RCRPGYTGTA		CQECSPGFHG		FPSCVPCHCS		AEGSLHAACD		PRSGQCSCRP
RVTGLRCDTC		VPGAYNFPYC		EAGSCHPAGL		APVDPALPEA		QVPCMCRAHV
EGPSCDRCKP		GFWGLSPSNP		EGCTRCSCDL		RGTLGGVAEC		QPGTGQCFCK
PHVCGQACAS		CKDGFFGLDQ		ADYFGCRSCR		CDIGGALGQS		CEPRTGVCRC
RPNTQGPTCS		EPARDHYLPD		LHHLRLELEE		AATPEGHAVR		FGFNPLEFEN
FSWRGYAQMA		PVQPRIVARL		NLTSPDLFWL		VFRYVNRGAM		SVSGRVSVRE
EGRSATCANC		TAQSQPVAFP		PSTEPAFITV		PQRGFGEPFV		LNPGTWALRV
EAEGVLLDYV		VLLPSAYYEA		ALLQLRVTEA		CTYRPSAQQS		GDNCLLYTHL
PLDGFPSAAG		LEALCRQDNS		LPRPCPTEQL		SPSHPPLITC		TGSDVDVQLQ
VAVPQPGRYA		LVVEYANEDA		RQEVGVAVHT		PQRAPQQGLL		SLHPCLYSTL
CRGTARDTQD		HLAVFHLDSE		ASVRLTAEQA		RFFLHGVTLV		PIEEFSPEFV
EPRVSCISSH		GAFGPNSAAC		LPSRFPKPPQ		PIILRDCQVI		PLPPGLPLTH
AQDLTPAMSP		AGPRPRPPTA		VDPDAEPTLL		REPQATVVFT		THVPTLGRYA
FLLHGYQPAH		PTFPVEVLIN		AGRVWQGHAN		ASFCPHGYGC		RTLVVCEGQA
LLDVTHSELT		VTVRVPKGRW		LWLDYVLVVP		ENVYSFGYLR		EEPLDKSYDF
ISHCAAQGYH		ISPSSSSLFC		RNAAASLSLF		YNNGARPCGC		HEVGATGPTC
EPFGGQCPCH		AHVIGRDCSR		CATGYWGFPN		CRPCDCGARL		CDELTGQCIC
PPRTIPPDCL		LCQPQTFGCH		PLVGCEECNC		SGPGIQELTD		PTCDTDSGQC
KCRPNVTGRR		CDTCSPGFHG		YPRCRPCDCH		EAGTAPGVCD		PLTGQCYCKE
NVQGPKCDQC		SLGTFSLDAA		NPKGCTRCFC		FGATERCRSS		SYTRQEFVDM
EGWVLLSTDR		QVVPHERQPG		TEMLRADLRH		VPEAVPEAFP		ELYWQAPPSY
LGDRVSSYGG		TLRYELHSET		QRGDVFVPME		SRPDVVLQGN		QMSITFLEPA
YPTPGHVHRG		QLQLVEGNFR		HTETRNTVSR		EELMMVLASL		EQLQIRALFS
QISSAVFLRR		VALEVASPAG		QGALASNVEL		CLCPASYRGD		SCQECAPGFY
RDVKGLFLGR		CVPCQCHGHS		DRCLPGSGVC		VDCQHNTEGA		HCERCQAGFV
SSRDDPSAPC		VSCPCPLSVP		SNNFAEGCVL		RGGRTQCLCK		PGYAGASCER
CAPGFFGNPL		VLGSSCQPCD		CSGNGDPNLL		FSDCDPLTGA		CRGCLRHTTG
PRCEICAPGF		YGNALLPGNC		TRCDCTPCGT		EACDPHSGHC		LCKAGVTGRR
CDRCQEGHFG		FDGCGGCRPC		ACGPAAEGSE		CHPQSGQCHC		RPGTMGPQCR
ECAPGYWGLP		EQGCRRCQCP		GGRCDPHTGR		CNCPPGLSGE		RCDTCSQQHQ
VPVPGGPVGH		SIHCEVCDHC		VVLLLDDLER		AGALLPAIHE		QLRGINASSM
AWARLHRLNA		SIADLQSQLR		SPLGPRHETA		QQLEVLEQQS		TSLGQDARRL
GGQAVGTRDQ		ASQLLAGTEA		TLGHAKTLLA		AIRAVDRTLS		ELMSQTGHLG
LANASAPSGE		QLLRTLAEVE		RLLWEMRARD		LGAPQAAAEA		ELAAAQRLLA
RVQEQLSSLW		EENQALATQT		RDRLAQHEAG		LMDLREALNR		AVDATREAQE
LNSRNQERLE		EALQRKQELS		RDNATLQATL		HAARDTLASV		FRLLHSLDQA
KEELERLAAS		LDGARTPLLQ		RMQTFSPAGS		KLRLVEAAEA		HAQQLGQLAL
NLSSIILDVN		QDRLTQRAIE		ASNAYSRILQ		AVQAAEDAAG		QALQQADHTW
ATVVRQGLVD		RAQQLLANST		ALEEAMLQEQ		QRLGLVWAAL		QGARTQLRDV
RAKKDQLEAH		IQAAQAMLAM		DTDETSKKIA		HAKAVAAEAQ		DTATRVQSQL
QAMQENVERW		QGQYEGLRGQ		DLGQAVLDAG		HSVSTLEKTL		PQLLAKLSIL
ENRGVHNASL		ALSASIGRVR		ELIAQARGAA		SKVKVPMKFN		GRSGVQLRTP
RDLADLAAYT		ALKFYLQGPE		PEPGQGTEDR		FVMYMGSRQA		TGDYMGVSLR
DKKVHWVYQL		GEAGPAVLSI		DEDIGEQFAA		VSLDRTLQFG		HMSVTVERQM
IQETKGDTVA		PGAEGLLNLR		PDDFVFYVGG		YPSTFTPPPL		LRFPGYRGCI
EMDTLNEEVV		SLYNFERTFQ		LDTAVDRPCA		RSKSTGDPWL		TDGSYLDGTG
FARISFDSQI		STTKRFEQEL		RLVSYSGVLF		FLKQQSQFLC		LAVQEGSLVL
LYDFGAGLKK		AVPLQPPPPL		TSASKAIQVF		LLGGSRKRVL		VRVERATVYS
VEQDNDLELA		DAYYLGGVPP		DQLPPSLRRL		FPTGGSVRGC		VKGIKALGKY
VDLKRLNTTG		VSAGCTADLL		VGRAMTFHGH		GFLRLALSNV		APLTGNVYSG
FGFHSAQDSA		LLYYRASPDG		LCQVSLQQGR		VSLQLLRTEV		KTQAGFADGA
PHYVAFYSNA		TGVWLYVDDQ		LQQMKPHRGP		PPELQPQPEG		PPRLLLGGLP
ESGTIYNFSG		CISNVFVQRL		LGPQRVFDLQ		QNLGSVNVST		GCAPALQAQT
PGLGPRGLQA		TARKASRRSR		QPARHPACML		PPHLRTTRDS		YQFGGSLSSH
LEFVGILARH		RNWPSLSMHV		LPRSSRGLLL		FTARLRPGSP		SLALFLSNGH
FVAQMEGLGT		RLRAQSRQRS		RPGRWHKVSV		RWEKNRILLV		TDGARAWSQE
GPHRQHQGAE		HPQPHTLFVG		GLPASSHSSK		LPVTVGFSGC		VKRLRLHGRP
LGAPTRMAGV		TPCILGPLEA		GLFFPGSGGV		ITLDLPGATL		PDVGLELEVR
PLAVTGLIFH		LGQARTPPYL		QLQVTEKQVL		LRADDGAGEF		STSVTRPSVL
CDGQWHRLAV		MKSGNVLRLE		VDAQSNHTVG		PLLAAAAGAP		APLYLGGLPE
PMAVQPWPPA		YCGCMRRLAV		NRSPVAMTRS		VEVHGAVGAS		GCPAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з LAMA5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6485 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
6. UniProt, O15230 (англ.) . Архів оригіналу за 11 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»