Щ-209 протягом Другої світової війни входив до складу підводних сил Чорноморського флоту ВМФ СРСР, за час воєнних дій здійснив 18 бойових походів. Провівши 12 торпедних атак та одну артилерійську, потопив 1 корабель та 2 шхуни, ще 2 шхуни були залишені екіпажами.
6 березня 1945 року Щ-209 як один з найбільш активних підводних човнів Чорноморського флоту нагороджений орденом Червоного Прапора.
А. В. Платонов. Энциклопедия советских подводных лодок 1941—1945. — М.: АСТ, 2004. — 592 с. — 3000 экз. — ISBN 5-17-024904-7.(рос.)
Морозов М. Э., Кулагин К. Л. «Щуки». Легенды Советского подводного флота. — М.: Яуза, Эксмо, 2008. — 176 с. — (Арсенал коллекция). — ISBN 978-5-699-25285-5.