Згідно з дослідженнями професора Костянтина Тищенка, «Чемер» древньою кельтською (валлійською) мовою означає «земляк»; подібні назви вже понад 2 000 років зустрічаються по всій Європі, наприклад — Кемері в Латвії і навіть Кемер у Туреччині.
Історія
Село Чемер було згадано в переписній книзі Малоросійського приказу (1666). Також наведено поіменні відомості про 51 чоловіка та 2 вдів на 53 двори. У 44 селянських дворах було 55 волів та 16 коней. 7 дворів були «ґрунтовими» (без орної худоби), 2 двори — «бобильськими» (без землі).[3]
У тутешній Михайлівській церкві був півчим юний Олекса Розум — майбутній граф Розумовський, таємний чоловік імператриці Єлизавети Петрівни. На старому церковищі в 1888 році було побудовано Михайлівську церкву, нині вона зруйнована.
З другої половини XIX століття збереглися спиртовий завод поміщиків Пашковських та їхній садибний будинок — пам'ятка дерев'яної архітектури; з радянських часів у ньому міститься сільський клуб. Кажуть, саме на тутешньому спиртозаводі вперше запустили у виробництво горілку чемергас — напій, у який додавалася дурманяча трава чемериця.
12 червня2020 року, відповідно до розпорядження Кабінету Міністрів України № 730-р від «Про визначення адміністративних центрів та затвердження територій територіальних громад Чернігівської області», село увійшло до складу Кіптівської сільської громади.[4]
17 липня2020 року, унаслідок адміністративно-територіальної реформи та ліквідації Козелецького району, село увійшло до складу Чернігівського району.[5]