Ерцгерцог був охрещений під повним ім'ям Марія Йосиф Фердинанд Карл Леопольд Антон Падуанський Йоганн Баптист Януарій Алоїз Гонзага Райнер Бенедикт Бернхард. Був сином ерцгерцога Австрії Карла Сальватора з тосканської гілки Габсбургів і його дружини Марії Іммакулати Бурбон–Сицилійської.
Після навчання в Терезіанської академії Франц Сальватор став лейтенантом 6–го уланського полку у 1881 році. В 1895 році приєднався до фельд'єгерів і потім знову перейшов до кавалерії. В тому ж році, під його патронством, відбулося реформація фехтування, шляхом впровадження італійського методу під керівництвом Луїджі Барбасетті.
31 липня1890 року ерцгерцог одружився з молодшою донькою австрійського імператора Франца Йосифа I, ерцгерцогинею Марією Валерією. Вінчання відбулося в парафіяльній церкві Ішлі, на органі грав австрійський композитор Антон Брукнер, а церемонію провів єпископ Лінца Франц Марія Доппельбауер[2]. Після цього Валері та Франц провели медовий місяць в Італії, Швейцарії та Баварії. В подружжя народилося 10 дітей: Єлизавета Франциска Австрійська (1892—1930), Франц Карл (1893—1918), Губерт Сальватор (1894—1971), Ядвіґа Австрійська (1896—1970), Теодор Сальватор (1899—1978), Гертруда Австрійська (1900—1962), Марія (1901—1936), Клеменс Сальватор (1904—1974), Матильда (1906—1991), Агнеса (1911—1911).
Шлюб, який спочатку був гармонійним, з часом зіпсувався, і Франц Сальватор почав шукати інших жінок. Він мав роман із Стефані фон Гогенлое (1891—1972) і був батьком її сина Франца Йосифа цу Гогенлое–Шиллінгсфюрста (1914—2008), який народився після її шлюбу з Фрідріхом Францем цу Гогенлое–Вальденбург–Шиллінгсфюрст. Франц Сальватор ще за життя дружини визнав Франца Йосифа позашлюбним сином.
У 1911 році він був призначений генералом кавалерії та командував кавалерійською дивізією у Відні. Під час Першої світової війни Франц Сальватор служив генеральним інспектором добровільної медичної допомоги (1914—1918)) був заступником протектора Червоного Хреста в Австрії та Угорщині. 12 квітня 1916 року Франц Сальватор інспектував у Львові діяльність Червоного хреста, систему евакуації поранених залізницею, відвідав школу для інвалідів.
У 1934 році, через 10 років після смерті Марії Валерії, Франц Сальватор одружився з Мелані фон Різенфельс (1898—1984), дочкою останнього барона фон Різенфельса.
.svg){kind=small}
.svg)
