Народилася 7 червня 1991 року у Лондоні (Велика Британія) в американській сім'ї. Батько — художник, поляк за національністю[7]. Мати — професор і письменниця, єврейка за національністю[7]. Росла в місті Енсінітас в Каліфорнії, потім у багатьох частинах Європи — довгий час прожила в Бантрі в Ірландії і на Мальорці в Іспанії.
У дитинстві мріяла стати актрисою. Грала в кількох спектаклях. Одночасно ходила на всілякі проби і кастинги. Вже у віці 14 років вона підписала контракт з модельним агентством Ford models. Поєднувала навчання в школі в Сан-Дієго (Каліфорнія) з роботою моделі в Лос-Анджелесі. Провчилася рік в Каліфорнійському університеті в Лос-Анджелесі, вивчаючи образотворче мистецтво, після чого вирішила повністю присвятити себе модельній кар'єрі. Після укладення контракту з Ford Models Емілі Ратаковскі працювала з брендами одягу Forever 21 і Nordstrom, але здобула популярність в модельному бізнесі після знімання декількох фотосесій з фотографом Тоні Дюраном.
У 2009—2010 році грала роль Таші в серіалі «iCarly» на телеканалі Nickelodeon. У серпні 2012 року Емілі Ратаковскі знялася разом з Сарою Джин Андервуд в рекламі мережі фастфудуCarl's Jr. У 2013 році знялася в двох музичних кліпах — «Blurred Lines» Робіна Тіка і «Love Somebody» Maroon 5. Зйомка топлес в «Blurred Lines» принесла їй велику популярність. YouTube спочатку заборонив відверту версію кліпу, але пізніше повернув її. Крім цього, модель оголилася і для календаря Sports Illustrated. За версіями модних видань Емілі не раз називали новим секс-символом і найбажанішою дівчиною 2014 року. Працювала з такими фотографами як Тоні Келлі, з яким вона знялася для обкладинки турецького GQ.
2014 року, продовжуючи акторську кар'єру, вона зіграла другорядну роль в кінофільмі «Загублена». У 2015 році вона з'явилася в драмі «128 ударів серця». Її партнером на майданчику став актор Зак Ефрон.
У 2014—2018 роках зустрічалася з музикантом Джеффом Мегідом[8][9].
23 лютого 2018 року одружилася з кінопродюсером та актором Себастьяном Бір-Макклардом, з яким зустрічалася кілька тижнів[10][11]. 8 березня 2021 року в пари народився син Сильвестр Аполло[12][13][14]. Сім'я мешкала в районі НоГо (Мангеттен) та в Лос-Анджелесі[15][16]. У липні 2022 року звинуватила Бір-Маккларда у зраді і пішла від нього[17], у вересні подала на розлучення. У жовтні 2022 розкритикувала рух MeToo[18].
.svg){kind=small}
