Народився у Венеції. Художню майстерність опановував у веронських художників Антоніо Баділе та у Доменіко Річчо, більш відомого як Доменіко Брузазорчі (1561-1567).
На відміну від стилістики маньєризму (пармського та римського зразків), котру розділяв Брузазочі, Зелотті був прихильником врівноваженої ренесансної манери в її декоративному варіанті. В цьому він був найближче до свого сучасника Паоло Веронезе, теж учня Антоніо Баділе і одного з найкращих фрескістів доби. Частку творів він виконав у співдружності із Паоло Веронезе, трохи поступаючись тому у значимості творів.
У зв'язку із скороченням торгівлі з країнами арабського сходу, венеційські багатії почали вкладати гроші у земельні ділянки на террафермі, ви розбудовують вілли та переходять на промислове вирощування рослин. Для венеційських архітекторів, художників-декораторів, скульпторів і садівників відкрились несподівано широкі можливості для творчості. Низинна, місцями болотяна терраферма вкрилась палацовими комплексами з заміськими віллами, пристанями на каналах, регулярними садами, прикрашеними парковими павільйонами та скульптурами. Засобом швидко і недорого прикрасити приміщення віл стала фреска. До створення численних декоративних фресок на террафермі і були залучені венеційські художники різного ступеня обдарованості, серед котрих були —
Джованні Баттіста Маганца старший (1509-1586) тощо.
Зростання майстерності Джованні Баттіста Зелотті було настільки помітним, що його залучили до створення пишних декоративних полотен у Палаці дожів та в Бібліотеці Марчіана в Венеції.
Наприкінці життя художник отримав запрошення на працю до герцогів Мантуї, де працював до власної смерті 28 серпня 1578 року.
Обрані твори (галерея фресок)
Джованні Баттіста Зелотті. Вілла Емо. Декоративна фреска в Західній залі.
Gerda Bödefeld und Berthold Hinz: Die Villen im Veneto. DuMont Kunst-Reiseführer, Köln 1987, ISBN 3-7701-1838-3
Michelangelo Muraro und Paolo Marton: Villen in Venetien. Könnemann, 1996, ISBN 3-89508-214-7
Cesare Bernasconi: Studi sopra la storia della pittura italiana dei secoli xiv e xv e della scuola pittorica veronese dai medi tempi fino tutto il secolo xviii. 1864, S. 333–334
Sydney J. Freedberg: Pelican History of Art: Painting in Italy, 1500-1600. Penguin Books, 1993, S. 559–560.
Irma B. Jaffe und Gernando Colombardo: Zelotti’s Epic Frescoes at Cataio. The Obizzi Saga. Fordham University Press, 2007, ISBN 9780823227426