Han företog flera vetenskapliga resor till Olonets, Onega och Vitahavsområdet, Sibirien samt till olika delar av Centraleuropa. Han studerade under sina resor främst torvmossarnas utveckling, växtarternas invandringsvägar och förhållandet mellan klimat, jordmån och vegetation samt skilda skogstyper. Han uppställde riktlinjer och arbetsprogram för växtgeografiska och växttopografiska undersökningar och är upphovsman till den så kallade skogstypsläran.
Under vinterkriget namngavs soldatuniformen (eller mera avsaknad av denna) efter Cajander. Denna uniform bestod av den stridandes egen klädsel, en kokard och ett bälte. I juni 1939 hade Cajander uttryckt sin förnöjdhet över att arméns anskaffningar (och kostnaderna) hade överförts till nästa år. Detta visade sig vara en grav felbedömning och ett stort men i det kommande kriget.
Familj
Aimo Cajander var bror till agronomen Eino Cajander.