GAMESS (US)

GAMESS
Тип ПО для вычислительной химии
Разработчик Iowa State University Quantum Chemistry Group
Написана на Фортран
Операционные системы Linux, FreeBSD, Unix и UNIX-подобные операционные системы, Microsoft Windows, Mac OS X
Последняя версия 20130501.1 (1 мая 2013)
Лицензия No cost license
Сайт msg.chem.iastate.edu/gam…

GAMESS (US) — программа пакета вычислительной квантовой химии.[1][2][3] Аббревиатура расшифровывается как General Atomic and Molecular Electronic Structure System. Разработка оригинального кода началась в 1977 году в рамках проекта национальных ресурсов для вычислений в химии (National Resources for Computations in Chemistry project)[4]. В 1981 году появились две стабильных ветви GAMESS: GAMESS (US) и GAMESS (UK), с тех пор их развитие шло самостоятельно и на сегодняшний день эти две программы отличаются довольно существенно. Проект GAMESS поддерживается членами исследовательской группы Гордона в Государственном Университете штата Айова.

Возможности

Суммарная таблица по ряду основных возможностей GAMESS
(C - хранение интегралов, D - прямые вычисления интегралов АО, p - параллельное исполнение, F - использование фрагментарных МО)
SCFTYP= RHF ROHF UHF GVB MCSCF
Энергия CDpF CDp CDp CDp CDpF
Аналитический градиент CDpF CDp CDp CDp CDpF
Численный Гессиан CDpF CDp CDp CDp CDp
Аналитический Гессиан CDp CDp - CDp CDp
MP2 энергия CDpF CDp CDp - CDp
MP2 градиент CDpF Dp CDp - -
CI энергия CDp CDp - CDp CDp
CI градиент CD - - - -
CC энергия CDpF - - - -
EOM энергия CD - - - -
DFT энергия CDpF CDp CDp - -
DFT градиент CDpF CDp CDp - -
MOPAC энергия yes yes yes yes -
MOPAC градиент yes yes yes - -

GAMESS (US) способен производить расчеты МО при помощи многих методов вычислительной квантовой химии, включая метод Хартри-Фока, теорию функционала плотности (DFT), теория валентных связей (GVB), и многоконфигурационное самосогласованное поле (MCSCF). Коррекция энергии электронной корреляции после процедуры самосогласования может быть осуществлена при помощи конфигурационного взаимодействия (CI), теории возмущений Меллера-Плессета второго порядка. Эффект растворителя может учитываться в рамках моделей SCRF, PCM или моделироваться с помощью, т.н. "эффективных фрагментов". Релятивистские поправки также могут быть учтены с помощью различных методов, например приближением Дугласа-Кролла третьего порядка.

Поскольку в программе молекулярная механика не реализована, комбинированные расчеты используют пакет TINKER для вычислений механической части. Метод фрагментарных МО может использоваться для расчета крупных систем, деля их на "фрагменты".

Связь с другими программами

GAMESS сохраняет расчет в текстовый файл специального формата. Хранящиеся в данном файле координаты могут быть преобразованы программой OpenBabel. Молекулярные орбитали можно визуализировать такими программами, как Molekel (англ. Molekel) или wxMacMolPlt.

Совместимость и доступность

US GAMESS работает на всех POSIX-совместимых операционных системах, OS X и Windows. На официальном сайте доступны бинарные пакеты для Mac OS X, MacOS 7-9 и Microsoft Windows. Также поддерживаются платформы Sun Solaris UltraSPARC/x86/x86-64, IBM BlueGene, AIX POWER/PowerPC, Linux x86/x86-64, Cray X1/XT Unicos, Fujitsu PrimePower Solaris, HP PA-RISC/x86 HP-UX и NEC SUPER-UX[5].

Исходный код US GAMESS распространяется бесплатно при условии некоммерческого использования программы.

См. также

Примечания

  1. ↑ Computational Chemistry, David Young, Wiley-Interscience, 2001. Appendix A. A.2.3 pg 334, GAMESS
  2. ↑ M.W. Schmidt et al. General Atomic and Molecular Electronic Structure System (англ.) // J. Comput. Chem.[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 14. — P. 1347—1363. — doi:10.1002/jcc.540141112.
  3. ↑ M. S. Gordon and M. W. Schmidt, Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later, in Theory and Applications of Computational Chemistry, the first 40 years, C. E. Dykstra, G. Frenking. K. S. Lim and G. E. Scusaria, Elsevier, Amsterdam, 2005.
  4. ↑ Gordon Research Group. GAMESS Manual (Introduction). Дата обращения: 15 ноября 2021. Архивировано 29 марта 2012 года.
  5. ↑ GAMESS Registration: download. Дата обращения: 14 февраля 2010. Архивировано 27 февраля 2010 года.

Внешние ссылки