С 1816 года — астроном в обсерватории в Готе. С 1825 по 1862 — директор Берлинской обсерватории[15] и редактор издания «Berliner astronomisches Jahrbuch».
Первую известность Энке принесли его работы по определению солнечного параллакса, расстояния от Земли до Солнца, размеров Солнечной системы. В основе метода определения солнечного параллакса лежала идея Эдмонда Галлея наблюдений прохождения Венеры по диску Солнца[9], проводимых в разных пунктах земного шара. Проведённые в 1761 и 1769 гг. в разных странах наблюдения прохождений дали ценный материал, общую обработку которого произвел Энке и вывел значение параллакса 8,5", мало отличающееся от значения, принятого в настоящее время (8,790").
Важное значение имели исследования Энке, посвящённые комете, получившей впоследствии его имя. В 1819 году установил, что кометы, открытые Пьером Мешеном (1786) и Ж.-Л. Понсом (1818), являются одной периодической кометой, которая движется по эллиптической орбите с периодом обращения 3,3 года. Комета Энке — одна из интереснейших комет, поскольку обладает самым коротким периодом обращения и малым перигелийным расстоянием[15].
Колчинский И. Г., Корсунь А. А., Родригес М. Г. Астрономы: Биографический справочник. — 2-е изд., перераб. и доп. — Киев: Наукова думка, 1986. — 512 с.
Энке (Encke) Иоганн Франц // Экслибрис — Яя. — М. : Советская энциклопедия, 1978. — С. 198. — (Большая советская энциклопедия : [в 30 т.] / гл. ред. А. М. Прохоров ; 1969—1978, т. 30).