Филокодекс

Пример кладограммы (Четвероногие), на узлах которой подписаны названия клад, регулируемых кодексом

«Междунаро́дный ко́декс фи́логенети́ческой номенклату́ры», или «Филоко́декс»[1] (англ. The International Code of Phylogenetic Nomenclature, PhyloCode), — свод правил, регулирующих вопросы филогенетической номенклатуры[2]. В своей текущей версии «Филокодекс» не предназначен для регулирования видовых названий, оставляя эту задачу соответствующим кодексам (МКЗН, МКН, МКНП^[англ.], МКНКР, МККиНВ^[исп.]). «Филокодекс» создан в рамках работы Международного общества филогенетической номенклатуры^[англ.][3]. Изначально кодекс написан на английском языке[4].

История

Теоретические основы кодекса были выработаны Кевином де Кейросом^[англ.] и Жаком Готье в серии публикаций в 1990-х годах[5], которые были предвосхищены идеей о том, что название таксона может выступать в качестве ссылки на часть филогенетического дерева[6].

Перед началом разработки кодекса было проведено три симпозиума, на которых инициативные группы определили теоретические положения кодекса. Первый симпозиум «Преобразование филогенетического анализа в классификацию» (англ. «Translating Phylogenetic Analyses into Classifications») был организован Ричардом Олмстидом в Американском институте биологических наук в Сан-Диего в 1995 году. Второй симпозиум под названием «Линнеевская иерархия: прошлое, настоящее и будущее» (англ. «The Linnean Hierarchy: Past, Present and Future») был организован Джеем Марком Портером в рамках Юго-западного симпозиума по ботанической систематике в ботаническом саде Ранчо Санта Ана^[англ.] в 1996 году. В 1999 году на XVI Международном ботаническом конгрессе в Сент-Луисе под руководством Филиппом Кантино и Торстеном Эрикссоном проведён последний симпозиум «Обзор и практическое применение филогенетической номенклатуры» (англ. «Overview and Practical Implications of Phylogenetic Nomenclature»).

Подготовка самого кодекса началась осенью 1997 года, когда Майкл Донохью, Филипп Кантино и Кевин де Кейрос решили провести семинар, состоявшийся 7 и 8 августа 1998 года в гербарии Гарвардского университета. Набросок кодекса, подготовленный Кантино, был значительно доработан 27-ю участниками семинара. Авторы опирались на некоторые положения других кодексов, а также частично на проект создававшегося в то время БиоКода (англ. BioCode)[7], призванного объединить существующие кодексы номенклатуры живых существ в единый гармоничный кодекс. Многие положения «Филокодекса» оказались уникальными для подобного рода документов по причине отсутствия опоры на понятие о таксономическом ранге.

Первая версия «Филокодекса» опубликована в Интернете 8 апреля 2000 г[8]. Вторая версия была выработана участниками семинара, подобного тем, что были проведены ранее. Первые пять версий «Филокодекса» публиковались только в электронном виде (форматы PDF и .doc)[8] и только шестая версия кодекса была издана в печатном виде[9].

Опубликованные версии «Филокодекса»

Версия	Дата опубликования
6	8 июня 2020
5	январь 2014
4c	12 января 2010
4b	12 сентября 2007
4a	31 июля 2007
3a	16 июня 2006
2b	17 июня 2004
2a	21 декабря 2003
2	30 сентрября 2003
Изначальное издание	8 апреля 2000

Содержание

Как и другие номенклатурные кодексы, «Филокодекс» подразделён на статьи, главы и части. Каждая статья так же может содержать заметки, примеры и рекомендации.

Содержание

• Предисловие
• Преамбула
• Часть I. Принципы
• Часть II. Правила
  • Глава I. Таксон (ст. 1–3)
  • Глава II. Публикация (ст. 4–5)
  • Глава III. Названия (ст. 6–8)
  • Глава IV. Названия клад (ст. 9–11)
  • Глава V. Выбор установленных названий (ст. 12–15)
  • Глава VI. Положения, касающиеся гибридов (ст. 16)
  • Глава VII. Орфография (ст. 17–18)
  • Глава VIII. Авторство названий (ст. 19)
  • Глава IX. Цитирование авторов и регистрацонные номера (ст. 20)
  • Глава X. Видовые названия (ст. 21)
  • Глава XI. Руководство (ст. 22)
• Словарь терминов
• Приложения
  • Приложение А. Прецедуры регистрации и требования к данным
  • Приложение Б. Свод этических правил

См. также

• Биологическая номенклатура
• Филогенетика
• Кладистика

Примечания

1. Павлинов И. Я. Таксономическая номенклатура. Книга 2. От Линнея до первых кодексов : [арх. 4 декабря 2023]. — М. : Т-во научн. изданий КМК, 2014. — С. 167. — 223 с. — (Зоологические исследования, № 15). — 300 экз. — ISBN 978-5-87317-989-3.
2. PhyloCode  (неопр.). phylonames.org. Дата обращения: 16 января 2024. Архивировано 19 декабря 2023 года.
3. Keesey, T. Michael. International Society for Phylogenetic Nomenclature  (неопр.). phylonames.org. Дата обращения: 16 января 2024. Архивировано 27 июля 2011 года.
4. На начало 2024 года кодекс не имеет переводов на другие языки.
5. Kevin de Queiroz, Jacques Gauthier. Phylogeny as a Central Principle in Taxonomy: Phylogenetic Definitions of Taxon Names // Systematic Zoology. — 1990-12. — Т. 39, вып. 4. — С. 307. — ISSN 0039-7989. — doi:10.2307/2992353.
6. Michael T. Ghiselin. "Definition," "Character," and Other Equivocal Terms // Systematic Zoology. — 1984. — Т. 33, вып. 1. — С. 104–110. — ISSN 0039-7989. — doi:10.2307/2413135. Архивировано 13 апреля 2024 года.
7. Draft BioCode (2011)  (неопр.). www.bgbm.org. Дата обращения: 16 января 2024. Архивировано 16 января 2024 года.
8. International Society for Phylogenetic Nomenclature: Documents  (неопр.). phylonames.org. Дата обращения: 16 января 2024.
9. Philip D. Cantino, Kevin De Queiroz. International code of phylogenetic nomenclature: PhyloCode. — Version 6. — Boca Raton, florida: CRC press, Taylor & Francis group, 2020. — ISBN 978-1-138-33282-9, 978-1-138-33286-7, 978-0-429-44632-0.