С 1920 года был профессором Петроградской консерватории.
Скончался 22 января1923 года от ушибов, полученных в автомобильной аварии на проспекте Обуховской обороны, когда он возвращался с шефского концерта для рабочих[2][3]. Похоронен в Некрополе мастеров искусств.
Первая жена — Мария Ивановна Шаховская, дочь Ивана Николаевича Шаховского и Елизаветы Николаевны Шаховской (Тепловой) (14(02).02.1858—?). В браке родилось три сына:
Александр Иоакимович Тартаков (1887, Киев — январь 1942, Ленинград) — получил режиссерское образование в Петрограде. Супруга: Елизавета Михайловна Потапова (1895—1982). Дочь Мария Александровна Тартакова (1924—2002).
Иван Иоакимович Тартаков (1895, Санкт-Петербург — 1949, Бельгия) — музыкант, во время революции эмигрировал. Дочь: Мари Либер (р. 1944).
Георгий Иоакимович Тартаков (1901—1977) — музыкант и педагог, автор биографической книги об отце «Книга о И. В. Тартакове».
Вторая жена — Мильда Карловна Тартакова (1888—1949). В браке родилась дочь Елизавета Иоакимовна Тартакова (1922—2001). Обе похоронены в Архангельске.
По непроверенному утверждению дирижёра Антона Шароева и писателя Осипа Дымова (на основании распространённых в ту пору слухов[4]), сам Иоаким Викторович мог быть внебрачным сыном Антона Рубинштейна; Шароев же утверждает, что внебрачным сыном Тартакова был его отец пианист Георгий Шароев[азерб.], в молодости выступавший с Тартаковым как аккомпаниатор и фигурировавший в афишах как Георгий Тартаков[5]
Тартаков Г. Иоаким Викторович Тартаков: К 100-летию со дня рождения // Музыкальная жизнь. — 1960. — № 23. — С. 16—17.
Тартаков Г. И. Иоаким Викторович Тартаков: (Краткая творческая биография и вокально-педагогическая практика) // Ученые записки / Азербайджанская гос. консерватория им. Узеира Гаджибекова. — Баку, 1966. — (Сер XIII: История и теория музыки). — № 2 (4). — С. 21—38.