Первое вручение состоялось 6 мая 2006 г. С момента учреждения и до 2012 года премия вручалась авторам альманаха «Полдень, XXI век», и номинаций было две: «проза» и «критика и публицистика». С 2016 года, после перерыва, премия вручается за публикации в альманахе «Полдень», а с 2017 номинация прозы разделена на «среднюю» и «малую» формы[1]. В 2023 году лист наминантов премии «Полдень» попали несколько рассказов из журнала «Мир фантастики» спецвыпуска «Советская фантастика»[2].
Литературная премия «Полдень» присуждается за лучшее произведение, опубликованное в альманахе в минувшем году. Награждается только произведение, поэтому один и тот же писатель может становиться лауреатом премии неоднократно[1].