На карте Санкт-Петербургской губернии Ф. Ф. Шуберта 1834 года обозначена деревня Падога, состоящая из 24 крестьянских дворов и к югу от неё мыза Падожская[8].
Согласно карте профессора С. С. Куторги 1852 года на месте деревни находилась мыза Подажская[10].
ПОДОГА — деревня вдовы коллежского советника Бибиковой, 21 верста по почтовой, а остальное по просёлкам, число дворов — 32, число душ — 83 м. п.[11] (1856 год)
ПАДОГА — деревня, число жителей по X-ой ревизии 1857 года: 92 м. п., 97 ж. п., всего 189 чел.[12]
Деревня Падога на карте 1860 года
Согласно «Топографической карте частей Санкт-Петербургской и Выборгской губерний» в 1860 году деревня называлась Падога и насчитывала 32 крестьянских двора[13].
ПОДОГА — мыза владельческая при реках Луге и Подожице, число дворов — 1, число жителей: 1 м. п., 2 ж. п.;
ПОДОГА — деревня владельческая при реке Подожице и пруде, число дворов — 25, число жителей: 93 м. п., 104 ж. п.[14] (1862 год)
В 1871—1873 годах временнообязанные крестьяне деревни Подоги выкупили свои земельные наделы у О. П. Веймарн и стали собственниками земли[15].
ПАДОГА — деревня, по земской переписи 1882 года: семей — 34, в них 98 м. п., 98 ж. п., всего 196 чел.[12]
Согласно материалам по статистике народного хозяйства Ямбургского уезда 1887 года мызы Александровская Горка и Подога общей площадью 3352 десятины принадлежали графу Александру Александровичу Лидерс-Веймарну, мызы были приобретены в 1883 году за 60 500 рублей. Кузница и ветряная мельница сдавались в аренду[16].
ПАДОГА — деревня, число хозяйств по земской переписи 1899 года — 30, число жителей: 72 м. п., 84 ж. п., всего 156 чел.; разряд крестьян: бывшие владельческие; народность: русская[12]
В конце XIX — начале XX века деревня административно относилась к Горской волости 2-го стана Ямбургского уезда Санкт-Петербургской губернии.
По данным «Памятных книжек Санкт-Петербургской губернии» за 1900 и 1905 годы мызы Падога и Александрова Горка общей площадью 2188 десятин принадлежали корнету запаса гвардии кавалерии барону Владимиру Владимировичу Меллер-Закомельскому[17][18].
С 1917 по 1927 год деревня Падога входила в состав Горкской волости Кингисеппского уезда.
С февраля 1927 года в составе Кингисеппской волости. С августа 1927 года в составе Кингисеппского района.
С 1928 года в составе Большелуцкого сельсовета. В 1928 году население деревни Падога составляло 183 человека[20].
По данным 1933 года деревня Падога являлась административным центром Большелуцкого сельсовета Кингисеппского района, в который входили 10 населённых пунктов: деревни Александровская Горка, Большой Луцк, Жабино, Калмотка, Кузьмино, Малый Луцк, Падога, Юркино, посёлок Ново-Стеклянный и выселок Александровская Горка, общей численностью 1270 человек[21].
План деревни Падога. 1938 год
Согласно топографической карте 1938 года деревня насчитывала 32 двора.
C 1 августа 1941 года по 31 января 1944 года деревня находилась в оккупации.
В 1958 году население деревни Падога составляло 139 человек[20].
По данным 1966, 1973 и 1990 годов деревня Падога также входила в состав Большелуцкого сельсовета[22][23][24].
В 1997 году в деревне Падога Большелуцкой волости проживали 48 человек, в 2002 году — 49 человек (русские — 90 %), в 2007 году — 43[25][26][27][28].