Окончил Высшую школу театра, кино и телевидения в Лодзи в 1954 году. Работал ассистентом режиссёра на съёмках фильмов «Атлантический рассказ» (реж. В. Якубовская), «Канал» и «Пепел и алмаз» (реж. А. Вайда), «Настоящий конец большой войны» (реж. Е. Кавалерович), был вторым режиссёром на съёмках фильма «Летучая» (реж. А. Вайда).
Моргенштерн дебютировал в 1960 году фильмом «До свидания, до завтра», отмеченном призами МКФ в Стратфорде и Сан-Франциско. Это лирический рассказ о безнадёжной любви польского студента и дочери западного дипломата (в главной роли выдающийся польский актёр Збигнев Цибульский).
Расстаться приходится и героям картины выпуска 1972 года «Надо убить эту любовь».
В числе наиболее значительных работ режиссёра — военная драма «Потом наступит тишина» и «Жизнь ещё раз».
Лента «Меньшее небо» получила Гран-при МКФ в Пуатье.
Большой вклад режиссёр внёс в развитие польского телевизионного кино, сняв в 1960—1970-е популярные телесериалы: «Ставка больше, чем жизнь», «Колумбы».
Снял также телесериалы «Польские пути» и «SOS», телефильмы «Час W» и «Пиковая дама».