Названия растений, описанных им, могут отмечаться сокращением«Clus.»
С точки зрения Международного кодекса ботанической номенклатуры научные названия растений, обнародованные до 1 мая 1753 г., не считаются действительно опубликованными, и в современной научной литературе это сокращение практически не встречается.
Один современник описывал Клузиуса как отца всех красивых садов в Европе[16]. На момент рождения Карла Клузиуса сады мало изменились с VIII века; Клузиус сыграл в их изменении значительную роль[18]. Ботаника становилась самостоятельной дисциплиной и больше не рассматривалась как отрасль медицины; растения представляли интерес только из-за своих лекарственных и кулинарных свойств, а Клузиус был одним из первых в Северной Европе, кто признавал растения сами по себе, оценивая их красоту так же, как их использование[16].
Карл Клузиус был приглашён в Вену для создания ботанического сада[16]; он был директором ботанического сада в Вене (1573—1587)[14] при дворе императора Максимилиана II[9][12][17]. Покровительство императора дало ему возможность путешествовать по всей Европе, собирая информацию для своих ботанических исследований, и внедрить ряд новых растений за пределами Европы[12].
Клузиус способствовал введению культуры картофеля в Европе[6], а также ввёл в Нидерландах тюльпаны[12][16]. Считается также, что он ввёл в западноевропейское садоводство пионы и гиацинты[19]. В 1593 году Клузиус стал почётным профессором ботаники в Лейдене[10][12]; эту должность он занимал до своей смерти[12]. Одним из важных достижений Клузиуса стало создание Лейденского ботанического сада, второго подобного учреждения к северу от Альп[12]. Он создал его в преклонном возрасте 67 лет[18]. В Лейденском ботаническом саду Карл Клузиус посадил несколько луковиц тюльпанов, которые были присланы ему из Константинополя Бюсбеком — послом Священной Римской империи при дворе султана Сулеймана I[20]. Несмотря на то, что тюльпаны были из Центральной Азии и к западу от Константинополя до этого не выращивались, они адаптировались к климатическим условиям северо-западной Европы[20]. Весной 1594 года первые тюльпаны расцвели на севере Нидерландов[16]. Это стало началом голландской индустрии луковичных растений[14].
Карл Клузиус является автором инновационных, всемирно известных ботанических публикаций[12]. Его считают «отцом микологии», потому что в 1601 году он написал первую монографию о грибах[15]. Это было региональное описание грибной флоры Венгрии — «Fungorum in Pannoniis observatorum brevis historia», которое вышло в общем томе «Rariorum plantarum historia», получившем позднее название «Кодекса Клузиуса» («Codex Clusianus»)[15]. Клузиус описал 47 «родов» и 105 «видов» грибов, снабдив описания довольно точными акварельными иллюстрациями[15]. Большинство грибов из «Кодекса Клузиуса» можно достаточно точно идентифицировать по иллюстрациям[21][22].
1561: Antidotarium sive de exacta componendorum miscendorumque medicamentorum ratione ll. III … nunc ex Ital. sermone Latini facti (Antwerpen. Ex officina Plantiniana).
1570: Galliae Narbonensis ora marittima (Antwerpen. Abraham Ortelius).
1571: Hispania nova descriptio (Antwerpen. Abraham Ortelius).
1582: Aliquot notae in Garciae Aromatum historiam (Antwerpen. Ex officina Plantiniana).
1583: Rariorum aliquot stirpium, per Pannoniam, Austriam, & vicinas quasdam provincias observatarum historia, IV libris expressa (Antwerpen. Ex officina Plantiniana).
1601: Rariorum plantarum historia / Fungorum in Pannoniis observatorum brevis historia. Exoticorum libri decem: quibus animalium, plantarum, aromatum, aliorumque peregrinorum fructuum historiæ discribuntur (Antwerpen. Ex officina Plantiniana apud Ioannem Moretum).
1605: Exoticorum libri decem: quibus animalium, plantarum, aromatum, aliorumque peregrin. fructuum historiae describuntur / item Pt. Bellonii Observationes, eodem C.C. interprete (Leiden: Ex officina Plantiniana).
1611: Curae posteriores, seu plurimarum non antè cognitarum, aut descriptarum stirpium, peregrinorumque aliquot animalium novae descriptiones: quibus & omnia ipsius opera, aliáque ab eo versa augentur, aut illustrantur: accessit seorsim Everardi Vorstii. .. de eiusdem Caroli Clusii Vita & obitu oratio, aliorumque Epicedia (Leiden & Antwerpen). Ex officina Plantiniana.
1619: Summi Galliae Belgicae corographica descriptio posthuma, ed. Joachim Morsius (Leiden: Jac. Marcus).
1630: Appendix cultori plantarum exoticarum necessaria. in Herbarium Horstianum (Marburg).
↑Duane Isley (1994) One Hundred and One Botanists.
↑ 12Александр Кокшаров. Пузырь или нет? //«Эксперт» № 1 (640) — 29 декабря 2008.
↑Леонтьєв Д. В., Акулов О. Ю. Загальна мікологія: Підручник для вищих навчальних закладів. — Харків: «Основа», 2007. — С. 192—206. — ISBN 978-966-495-040-1. (Общая микология: Учебник для высших учебных заведений). (укр.)
↑Курсанов Л. И.Очерк развития микологии // Микология. — М.: Учпедгиз, 1940.
↑Charles Plumier: Nova Plantarum Americanarum Genera. Leiden 1703, S. 20f.
Karl Mägdefrau: Geschichte der Botanik. Leben und Leistung großer Forscher. Stuttgart, Gustav Fischer Verlag, 2. Auflage, 1992, ISBN 3-437-20489-0. (нем.)
Heinrich Dörfelt, Heike Heklau: Geschichte der Mykologie. Schwäbisch-Gmünd, Einhorn Verlag 1998, ISBN 3-927654-44-2. (нем.)
Ilse Jahn: Geschichte der Biologie. Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2000, ISBN 3-8274-1023-1. (нем.)
Heinrich Wilhelm Reichardt: Clusius, Carolus. In: Allgemeine Deutsche Biographie (ADB). Band 4, Duncker & Humblot, Leipzig 1876, S. 349—351. (нем.)
Hunger, Friedrich Wilhelm Tobias. Charles de L’Escluse (Carolus Clusius) Nederlandsch kruidkundige, 1526—1609. 2 vols. The Hague: M. Nijhoff, 1927—1943. (нид.)
Smit, P. «Carolus Clusius and the beginning of botany in Leiden University». Janus. 60 (1973) 87—92. (англ.)
Ogilvie, Brian W. «The Science of Describing: Natural History in Renaissance Europe». Chicago: University of Chicago Press, 2006. (англ.)
Чикин Ю. А. Общая фитопатология (часть 1): Учебное пособие. — Томск: ТГУ, 2001. — 170 с. (рус.)
Леонтьєв Д. В., Акулов О. Ю. Загальна мікологія: Підручник для вищих навчальних закладів. — Харків: «Основа», 2007. — С. 192—206. — ISBN 978-966-495-040-1. (Общая микология: Учебник для высших учебных заведений). (укр.)
Курсанов Л. И.Очерк развития микологии // Микология. — М.: Учпедгиз, 1940. (рус.)