Вирус Зика

Вирус Зика
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Класс:
Flasuviricetes
Порядок:
Amarillovirales
Семейство:
Род:
Вид:
Вирус Зика
Международное научное название
Zika virus
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы

Вирус Зика (англ. Zika virus, ZIKV) — вид вирусов рода Flavivirus (семейство Flaviviridae), переносимый комарами рода Aedes. У людей вызывает одноимённое заболевание, характерными симптомами которого являются сыпь, утомление, головная и суставная боль, лихорадка, опухание суставов[англ.][2][3]. Вирус открыт в 1947 году, после чего в течение 60 лет было описано лишь 15 случаев заболевания в Чёрной Африке и Юго-Восточной Азии[2]. В настоящее время имеет статус пандемии[4]. Клинические проявления подобны лихорадкам денге и чикунгунья, аналогичные симптомы также имеют краснуха, корь, лептоспироз, риккетсиозы; окончательный диагноз ставится на основании лабораторных тестов[5]. Специфичных лекарств против вируса Зика не существует[6], ведутся клинические испытания вакцины на основе ДНК[7].

Строение

Строение оболочки вириона вируса Зика (PDB 5IRE). Симметрически неэквивалентные мономеры белка Е окрашены разными цветами

Структура вируса Зика изучалась методом криоэлектронной микроскопии[8][9]. Подобно другим флавивирусам, вирус Зика окружён оболочкой, состоящей из 180 копий белка E и 180 копий белка M, заякоренных в мембране вириона[9]. Вирионы отличаются высокой термостабильностью, сохраняя регулярную структуру даже при 40 °C благодаря наличию характерной сети водородных связей и других взаимодействий между эктодоменами белка Е[9]. Внешняя белковая оболочка имеет икосаэдрическую симметрию и сформирована эктодоменами белка E, гликозилированными по остатку Asn154[8][9]. Согласно рентгеноструктурным данным, петля, в которой находится этот сайт гликозилирования («150-петля»), длиннее, чем у других флавивирусов[10], обладает повышенной подвижностью и окружена уникальной относительно других изученных флавивирусов положительно заряженной областью[11].

Нейтрализующие антитела[англ.] к эпитопу белка Е вируса денге, расположенному в области контакта между димерами, эффективно взаимодействуют и с белком Е вируса Зика[10].

Нуклеокапсид с несегментированным, одноцепочечным, положительно-направленным РНК-геномом[12].

Неструктурный белок NS1 вируса Зика сходен по структуре C-концевого фрагмента с аналогичными белками других флавивирусов, однако имеет иное распределение электростатического потенциала на поверхности, а также довольно сильно отличается по аминокислотной последовательности, образуя отдельную ветвь филогенетического дерева. Предполагается, что эти отличия являются одной из причин нестандартного для флавивирусов патогенеза вируса Зика[13].

Структура геликазы вируса Зика была определена методом рентгеноструктурного анализа. Фермент состоит из трёх доменов I—III, между доменами I и II расположен предполагаемый центр связывания нуклеотидов, а молекула РНК связывается между доменом III и доменами I и II[14].

Таксономическое положение

Вместе с вирусом Спондвени[англ.] образует серокомплекс Спондвени[12].

История распространения

Впервые вирус был изолирован в 1947 году из макак-резусов в лесу Зика (Уганда), по которому и получил название. В 1948 году изолирован из комаров Aedes africanus[англ.], пойманных в том же лесу. В 1968 году впервые найден у людей в Нигерии. С 1951 по 1981 годы серологические доказательства наличия вируса были получены в Уганде, Танзании, Египте, ЦАР, Сьерра-Леоне, Габоне, а также в Азии — в Индии, Малайзии, на Филиппинах, в Таиланде, Вьетнаме и Индонезии. Вирус выделяли из комаров в Кот-д'Ивуаре и Малайзии, у людей в Сенегале. В 2007 году произошла крупная вспышка заболевания, вызванного вирусом Зика, на острове Яп[15], откуда началось распространение вируса на восток через Тихий океан[2]. В 2014 году вирус достиг Новой Каледонии, островов Кука, Французской Полинезии, в 2015 году — острова Пасхи и Южной Америки, Центральной Америки, Вест-Индии[2].

В 2015 году началось активное распространение вируса в Южной и Центральной Америке.

Предполагаемая история распространения вируса Зика по Африке[16].

На основании филогенетического анализа обширного набора штаммов вируса была высказана гипотеза, что вирус Зика впервые появился в Уганде в 20-е годы XX века, после чего дважды независимо распространился в Западную Африку — около 1935 года в Нигерию и Сенегал через ЦАР, а также около 1940 года в Кот-д’Ивуар и затем в Сенегал; азиатские штаммы вируса, вероятно, в конце 1940-х были занесены в Малайзию, а в 1960-е — в Микронезию[16].

Жизненный цикл

Предполагается, что вирус первоначально инфицирует дендритные клетки около места внедрения, затем распространяется в лимфатические узлы и кровоток[12]. Репликация флавивирусов обычно происходит в цитоплазме, однако белок оболочки вируса Зика был обнаружен в ядрах инфицированных клеток с помощью моноклональных антител к вирусу Западного Нила[17].

Передача

Основной путь передачи вируса Зика человеку — через укусы самок активных в дневное время комаров рода Aedes[5]: прежде всего Aedes aegypti и Aedes albopictus, а также древесных комаров Aedes africanus, Aedes apicoargenteus, Aedes furcifer, Aedes hensilli, Aedes luteocephalus и Aedes vitattus. Инкубационный период в комарах составляет примерно 10 дней[15]. Позвоночные носители вируса — как правило, обезьяны и люди. До начала пандемии в 2007 году вирус Зика «редко вызывал заметные „избыточные“ заболевания у человека, даже в высоко энзоотичных районах»[4].

Возможна передача вируса Зика от мужчины к женщине либо иному пассивному половому партнёру в результате полового контакта. Первый случай был зарегистрирован в 2009 году, когда по возвращении из экспедиции в Сенегал учёный-энтомолог из Колорадо передал вирус своей жене; симптомы лихорадки Зика проявлялись у них спустя порядка 9 дней после предполагаемой даты инфицирования[18][19]. Во время эпидемии лихорадки Зика во Французской Полинезии (2013) вирус был обнаружен в семенной жидкости и моче одного из пациентов на Таити, дважды перенёсшего острую фазу заболевания в течение 8 недель; несмотря на наличие вируса в сперме, в крови его обнаружить в это же время не удавалось[20]. В обоих случаях у пациентов наблюдалась гемоспермия[18][20]. Во время вспышки 2015—2016 годов только в США было зарегистрировано 6 случаев передачи вируса половым путём[21]. Передача вируса женщинами не регистрировалась[21]. Согласно рекомендациям Центра по контролю и профилактике заболеваний США (CDC), для предотвращения передачи вируса Зика половым путём мужчинам следует постоянно использовать презервативы либо воздерживаться от половых контактов: не менее 8 недель после посещения эндемичных территорий при отсутствии симптомов заболевания, не менее 6 месяцев после перенесённого заболевания с клиническими проявлениями[21].

В 2015 году РНК вируса Зика была обнаружена в околоплодных водах двух зародышей. Это показало, что вирус проникает через плаценту и может вызвать инфекцию у плода[22].

Клиническая картина

Сыпь на руке, вызванная вирусом Зика

Общие симптомы вирусной инфекции включают лёгкую головную боль, макулопапулёзную сыпь, жар, недомогание, конъюнктивит и боли в суставах. Первый хорошо задокументированный случай заражения вирусом Зика был описан в 1964 году. В начале заболевания пациент жаловался на лёгкую головную боль, затем последовала сыпь, лихорадка и боль в спине. В течение двух дней сыпь начала проходить, через три дня спал жар и осталась только лёгкая сыпь. Сыпь была наиболее распространённым симптомом среди заболевших лихорадкой Зика в 2015 году в Рио-де-Жанейро[23]. До настоящего времени лихорадка Зика считалась достаточно лёгким заболеванием. Только у одного человека из пяти проявлялись симптомы заболевания, отсутствует смертность, однако истинный потенциал вируса до сих пор не известен[15].

По состоянию на июнь 2016 года не существует вакцин и лекарств для профилактики или специфического лечения лихорадки Зика. Симптомы можно облегчить, используя парацетамол, тогда как аспирин и другие НПВС можно применять только после исключения лихорадки денге из-за риска кровотечений[24].

Вирус обладает выраженным нейротропизмом и эффективно инфицирует нейрональные прогениторные клетки. С помощью органоидов, имитирующих эмбриональное развитие переднего мозга[англ.], были продемонстрированы нарушения, возникающие при размножении вируса Зика в мозге плода, и их аналогия с изменениями, характерными для микроцефалии[25].

Диагностика

Существуют два типа диагностических тестов для определения вируса Зика в сыворотке, выделенной во время острой фазы заболевания[26][15]. Иммуноферментные тесты построены на определении специфичного иммуноглобулина M; часто дают перекрёстные реакции с вирусом денге, реже — с вирусами жёлтой лихорадки, лихорадки Западного Нила, японского энцефалита, энцефалита долины Муррея[15], однако существуют и достаточно специфичные наборы для ИФА[27]. Тесты, основанные на прямом определении вируса или его компонентов, более надёжны, однако длительны и требуют более квалифицированного персонала[26][15]. ПЦР-тесты, основанные на определении вирусной РНК, наиболее популярны и могут проводиться с использованием образцов, полученных не позднее 10 дней после начала заболевания[26][15]. Реакция нейтрализации методом бляшек имеет более высокую специфичность[15].

Схемы дифференциальной диагностики различаются в зависимости от фазы заболевания. Во время острой фазы (менее 7 дней после появления симптомов) сначала проводится определение белка NS1 вируса денге методом ПЦР в реальном времени, затем при отрицательном результате тем же методом проводится определение вируса чикунгунья. При отрицательных результатах обоих тестов и положительном результате ПЦР-теста на вирус Зика ставится диагноз. На более поздних стадиях (свыше 4 дней после появления симптомов) по аналогичной схеме проводится диагностика на основе определения специфичных IgM[5].

Ингибиторы репликации

7-Деаза-2′-C-метиладенозин[вд] проявляет ингибиторные свойства по отношению к репликации вируса Зика[28][29] и замедляет течение болезни у мышей[28]. 2′-C-Метилцитидин, рибавирин, фавипиравир и T-1105 ингибируют цитопатическое действие вируса и уменьшают его урожай[28]. Высокую эффективность подавления репродукции вируса in vitro проявляет также 2′-C-метиладенозин, 2′-C-метилгуанозин и 2′-C-метилуридин менее эффективны[29].

Источники

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. 1 2 3 4 Enserink M. An obscure mosquito-borne disease goes global (англ.) // Science. — 2015. — Vol. 350, no. 6264. — P. 1012—1013. — doi:10.1126/science.350.6264.1012.
  3. Vogel G. A race to explain Brazil's spike in birth defects (англ.) // Science. — 2016. — Vol. 351, no. 6269. — P. 110—111. — doi:10.1126/science.351.6269.110.
  4. 1 2 Fauci A. S., Morens D. M. Zika Virus in the Americas — Yet Another Arbovirus Threat (англ.) // The New England Journal of Medicine / J. M. Drazen, F. J. IngelfingerMMS, 2016. — Vol. 374, Iss. 7. — P. 601—604. — 4 p. — ISSN 0028-4793; 1533-4406doi:10.1056/NEJMP1600297PMID:26761185
  5. 1 2 3 Korzeniewski K., Juszczak D., Zwolińska E. Zika — another threat on the epidemiological map of the world (англ.) // (unknown type) — 2016. — Vol. 67, Iss. 1. — P. 31—37. — 7 p. — doi:10.5603/IMH.2016.0007PMID:27029927
  6. Symptoms, Diagnosis, & Treatment. Дата обращения: 4 октября 2017. Архивировано 30 апреля 2016 года.
  7. Abbasi J. Zika Vaccine Enters Clinical Trials (англ.) // JAMA. — 2016. — Vol. 316. — P. 1249. — doi:10.1001/jama.2016.12760.
  8. 1 2 Sirohi D., Chen Z., Sun L., Klose T., Pierson T. C., Rossmann M. G., Kuhn R. J. The 3.8 A resolution cryo-EM structure of Zika virus (англ.) // Science / H. Thorp — Northern America: AAAS, 2016. — Vol. 352, Iss. 6284. — P. 467—470. — 4 p. — ISSN 0036-8075; 1095-9203doi:10.1126/SCIENCE.AAF5316PMID:27033547
  9. 1 2 3 4 Kostyuchenko V. A., Lim E. X. Y., Zhang S., Fibriansah G., Ng T., Shi J., Lok S. Structure of the thermally stable Zika virus (англ.) // Nature / M. SkipperNPG, Springer Science+Business Media, 2016. — Vol. 533, Iss. 7603. — P. 425—428. — 4 p. — ISSN 1476-4687; 0028-0836doi:10.1038/NATURE17994PMID:27093288
  10. 1 2 Barba-Spaeth G., Rouvinski A., Dejnirattisai W., Medits I., Vaney M., Sharma A., Simon-Lorière E., Sakuntabhai A., Cao-Lormeau V., Haouz A. et al. Structural basis of potent Zika–dengue virus antibody cross-neutralization (англ.) // Nature / M. SkipperNPG, Springer Science+Business Media, 2016. — Vol. 536, Iss. 7614. — P. 48—53. — 6 p. — ISSN 1476-4687; 0028-0836doi:10.1038/NATURE18938PMID:27338953
  11. Dai L., Song J., Lu X., Musyoki A. M., Cheng H., Zhang Y., Yuan Y., Deng Y., Xiao H., Song H. et al. Structures of the Zika Virus Envelope Protein and Its Complex with a Flavivirus Broadly Protective Antibody (англ.) // Cell Host & MicrobeCell Press, Elsevier BV, 2016. — Vol. 19, Iss. 5. — P. 696—704. — 9 p. — ISSN 1931-3128; 1934-6069doi:10.1016/J.CHOM.2016.04.013PMID:27158114
  12. 1 2 3 Knipe, David M.; Howley, Peter M. Fields Virology (неопр.). — 5th. — Lippincott Williams & Wilkins[англ.], 2007. — С. 1156, 1199. — ISBN 978-0-7817-6060-7. Архивировано 11 января 2023 года.
  13. Song H., Qi J., Haywood J., Shi Y., Gao G. F. Zika virus NS1 structure reveals diversity of electrostatic surfaces among flaviviruses (англ.) // Nature Structural & Molecular Biology — United States of America: NPG, 2016. — Vol. 23, Iss. 5. — P. 456—458. — 3 p. — ISSN 1545-9993; 1545-9985doi:10.1038/NSMB.3213PMID:27088990
  14. Tian H., Ji X., Yang X., Xie W., Yang K., Chen C., Wu C., Chi H., Mu Z., Wang Z. et al. The crystal structure of Zika virus helicase: basis for antiviral drug design (англ.) // Protein & Cell / R. ZiheSpringer Science+Business Media, SpringerOpen, 2016. — Vol. 7, Iss. 6. — P. 450—454. — 5 p. — ISSN 1674-800X; 1674-8018doi:10.1007/S13238-016-0275-4PMID:27172988
  15. 1 2 3 4 5 6 7 8 Hayes E. B. Zika virus outside Africa (англ.) // Emerging Infectious DiseasesCDC, 2009. — Vol. 15, Iss. 9. — P. 1347—1350. — 4 p. — ISSN 1080-6040; 1080-6059doi:10.3201/EID1509.090442PMID:19788800
  16. 1 2 Faye O., Freire C. C. M., Iamarino A., Oliveira J. V. C. d., Faye O., Diallo M., Zanotto P. M. A., Sall A. A. Molecular evolution of Zika virus during its emergence in the 20(th) century (англ.) // PLOS Neglected Tropical Diseases / P. J. HotezPLoS, 2014. — Vol. 8, Iss. 1. — P. e2636. — ISSN 1935-2735; 1935-2727doi:10.1371/JOURNAL.PNTD.0002636PMID:24421913
  17. Buckley A., Gould E. A. Detection of Virus-specific Antigen in the Nuclei or Nucleoli of Cells Infected with Zika or Langat Virus (англ.) // Journal of General Virology / G. L. SmithMicrobiology Society, 1988. — Vol. 69 ( Pt 8), Iss. 8. — P. 1913—1920. — 8 p. — ISSN 0022-1317; 1465-2099doi:10.1099/0022-1317-69-8-1913PMID:2841406
  18. 1 2 Foy B. D., Kobylinski K. C., Foy J. L. C., Blitvich B. J., Rosa A. T. d., Tesh R. B., Lanciotti R. S., Haddow A. D. Probable non-vector-borne transmission of Zika virus, Colorado, USA (англ.) // Emerging Infectious DiseasesCDC, 2011. — Vol. 17, Iss. 5. — P. 880—2. — ISSN 1080-6040; 1080-6059doi:10.3201/EID1705.101939PMID:21529401
  19. Enserink M. Sex After a Field Trip Yields Scientific First. Science News (6 апреля 2011). Дата обращения: 18 мая 2016. Архивировано 6 марта 2019 года.
  20. 1 2 Musso D., Roche C., Robin E., Nhan T., Teissier A., Cao-Lormeau V. Potential sexual transmission of Zika virus (англ.) // Emerging Infectious DiseasesCDC, 2015. — Vol. 21, Iss. 2. — P. 359—61. — ISSN 1080-6040; 1080-6059doi:10.3201/EID2102.141363PMID:25625872
  21. 1 2 3 Oster A. M., Russell K., Stryker J. E., Friedman A., Kachur R. E., Petersen E. E., Jamieson D. J., Cohn A. C., Brooks J. T. Update: Interim Guidance for Prevention of Sexual Transmission of Zika Virus — United States, 2016 (англ.) // Morbidity and Mortality Weekly ReportCDC, 2016. — Vol. 65, Iss. 12. — P. 323—325. — 3 p. — ISSN 0149-2195; 1545-861X; 1546-0738; 1545-8636doi:10.15585/MMWR.MM6512E3PMID:27032078
  22. Gretchen Vogel. Fast-spreading virus may cause severe birth defects Архивная копия от 9 декабря 2015 на Wayback Machine Science Magazine American Association for the Advancement of Science. 3 December 2015, retrieved 7 January 2016
  23. Neto J. C., Mesquita E. C., Souza T. M. L., Parreira V., Wittlin B. B., Durovni B., Lemos M. C. F., Vizzoni A., Sampaio S. A., Gonçalves B. d. S. et al. Clinical Manifestations of Zika Virus Infection, Rio de Janeiro, Brazil, 2015 (англ.) // Emerging Infectious DiseasesCDC, 2016. — Vol. 22, Iss. 7. — P. 1318—1320. — 3 p. — ISSN 1080-6040; 1080-6059doi:10.3201/EID2207.160375PMID:27070847
  24. Zika Virus For Health Care Providers: Clinical Evaluation & Disease Архивная копия от 13 сентября 2017 на Wayback Machine CDC, June 1, 2015, retrieved January 8, 2016
  25. Qian X., Nguyen H. N., Song M. M., Hadiono C., Ogden S. C., Yao B., Hamersky G. R., Hammack C., Zhong C., Yoon K. et al. Brain-Region-Specific Organoids Using Mini-bioreactors for Modeling ZIKV Exposure (англ.) // CellCell Press, Elsevier BV, 2016. — Vol. 165, Iss. 5. — P. 1238—1254. — 17 p. — ISSN 0092-8674; 1097-4172doi:10.1016/J.CELL.2016.04.032PMID:27118425
  26. 1 2 3 Shan C., Barrett A. D. T., Xie X., Garcia-Blanco M. A., Tesh R. B., Shi P., Vasilakis N., Vasconcelos P. F. d. C., Weaver S. C. Zika Virus: Diagnosis, Therapeutics, and Vaccine (англ.) // ACS infectious diseasesACS, 2016. — Vol. 2, Iss. 3. — P. 170—172. — 3 p. — ISSN 2373-8227doi:10.1021/ACSINFECDIS.6B00030PMID:27623030
  27. Huzly D., Hanselmann I., Schmidt-Chanasit J., Panning M. High specificity of a novel Zika virus ELISA in European patients after exposure to different flaviviruses (англ.) // EurosurveillanceECDC, 2016. — Vol. 21, Iss. 16. — ISSN 1025-496X; 1560-7917doi:10.2807/1560-7917.ES.2016.21.16.30203PMID:27126052
  28. 1 2 3 Zmurko J., Marques R. E., Schols D., Kaptein S. J. F., Neyts J. The Viral Polymerase Inhibitor 7-Deaza-2'-C-Methyladenosine Is a Potent Inhibitor of In Vitro Zika Virus Replication and Delays Disease Progression in a Robust Mouse Infection Model (англ.) // PLOS Neglected Tropical Diseases / P. J. HotezPLoS, 2016. — Vol. 10, Iss. 5. — P. e0004695. — ISSN 1935-2735; 1935-2727doi:10.1371/JOURNAL.PNTD.0004695PMID:27163257
  29. 1 2 Eyer L., Nencka R., Huvarová I., Palus M., Alves M. J., Růžek D., Gould E. A., Clercq E. D. Nucleoside inhibitors of Zika virus (англ.) // Journal of Infectious DiseasesOUP, 2016. — Vol. 214, Iss. 5. — P. 707—11. — ISSN 0022-1899; 1537-6613doi:10.1093/INFDIS/JIW226PMID:27234417

Ссылки