Está situada na área sudeste da ilha – nas Terras Altas da Islândia, cobrindo mais de 8% do país.
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Com os seus 7.700 km², é a segunda maior calota de gelo da Europa em termos de área e a maior em termos de volume.
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A espessura do gelo é em média 420 m e pode atingir os 1000 m.
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Por baixo do glaciar - assim como por baixo de muitos dos glaciares da Islândia - existem vulcões, com destaque para o Bárðarbunga (o maior) e o Grímsvötn (o mais ativo). Os lagos formados pelas erupções vulcânicas - como por exemplo o Grímsvötn, podem causar inundações glaciares (jökulhlaup) – como aconteceu em 1996.
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O Vatnajökull tem vindo a diminuir de tamanho há já alguns anos, possivelmente devido a alterações climáticas e actividade vulcânica recente.
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↑Rydstedt, Bjarne; Georg Andersson, Torsten Bladh, Mona Larsson, Per Olof Köhler, Karl-Gustaf Thorén (1988). «Mera om Islaand». Land och liv 2 (em sueco). Estocolmo: Natur och kultur. p. 41. 240 páginas. ISBN9127625672A referência emprega parâmetros obsoletos |coautor= (ajuda)
↑ abGudrun GisladottirMorten e Kyndby Holm. «Vatnajökull» (em dinamarquês). Den Store Danske Encyklopædi – Grande Enciclopédia Dinamarquesa. Consultado em 3 de novembro de 2023
↑«Island - en introduktion». Island. Fyris reseguider (em sueco). Malmö: Fyris. 2009. p. 5. 128 páginas. ISBN978-918557939-6|acessodata= requer |url= (ajuda)
↑Rydstedt, Bjarne; Georg Andersson, Torsten Bladh, Mona Larsson, Per Olof Köhler, Karl-Gustaf Thorén (1988). «Mera om Island». Land och liv 2 (em sueco). Estocolmo: Natur och kultur. p. 41. 240 páginas. ISBN9127625672A referência emprega parâmetros obsoletos |coautor= (ajuda)