A maior parte das espécies conhecidas habitam o aparelho digestivo de animais, onde podem viver em simbiose com o hospedeiro, como Wolinella spp. em bovinos, ou atuam como patógenos, como Helicobacter spp. no estômago e Campylobacter spp. no duodeno. Contudo, indivíduos do filo já foram encontrados também em habitats ambientais como fissuras hidrotermais e áreas de emanação fria. Estes isolados ambientais incluem as espécies Sulfurimonas autotrophica,[3]Sulfurimonas paralvinellae,[4]Sulfurovum lithotrophicum[5] eNautilia profundicola.[6]
↑Inagaki, F. (1 de novembro de 2003). «Sulfurimonas autotrophica gen. nov., sp. nov., a novel sulfur-oxidizing -proteobacterium isolated from hydrothermal sediments in the Mid-Okinawa Trough». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (6): 1801–1805. ISSN1466-5026. PMID14657107. doi:10.1099/ijs.0.02682-0
↑Takai, K. (1 de agosto de 2006). «Sulfurimonas paralvinellae sp. nov., a novel mesophilic, hydrogen- and sulfur-oxidizing chemolithoautotroph within the Epsilonproteobacteria isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete nest, reclassification of Thiomicrospira denitrificans as Sulfurimonas denitrificans comb. nov. and emended description of the genus Sulfurimonas». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 56 (8): 1725–1733. ISSN1466-5026. PMID16901999. doi:10.1099/ijs.0.64255-0
↑Inagaki, Fumio; Ken Takai; Kenneth H. Nealson; Koki Horikoshi (1 de setembro de 2004). «Sulfurovum lithotrophicum gen. nov., sp. nov., a novel sulfur-oxidizing chemolithoautotroph within the ε-Proteobacteria isolated from Okinawa Trough hydrothermal sediments». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 54 (5): 1477–1482. ISSN1466-5026. PMID15388698. doi:10.1099/ijs.0.03042-0