Negativicutes

Negativicutes
Classificação científica
Domínio: Bacteria Filo: Firmicutes Classe: Negativicutes Marchandin et al. 2010 Ordem: Selenomonadales Marchandin et al. 2010
Familias e Xéneros
Acidaminococcaceae Marchandin et al. 2010 Acidaminococcus Rogosa 1969 emend. Jumas-Bilak et al. 2007 Phascolarctobacterium Del Dot et al. 1994 Succiniclasticum van Gylswyk 1995 Succinispira Janssen e O'Farrell 1999 Veillonellaceae Rogosa 1971 emend. Marchandin et al. 2010 Acetonema Kane e Breznak 1992 Allisonella Garner et al. 2003 Anaeroarcus Strömpl et al. 1999 Anaeroglobus Carlier et al. 2002 Anaeromusa Baena et al. 1999 Anaerosinus Strömpl et al. 1999 Anaerospora ♠ Woo et al. 2005 Anaerovibrio Hungate 1966 Centipeda Lai et al. 1983 Dendrosporobacter Strömpl et al. 2000 Desulfosporomusa ♠ Sass et al. 2004 Dialister (ex Bergey et al. 1923) Moore e Moore 1994 emend. Morotomi et al. 2008 Megamonas Shah e Collins 1983 Megasphaera Rogosa 1971 emend. Marchandin et al. 2003 Mitsuokella Shah e Collins 1983 Negativicoccus Marchandin et al. 2010 Pectinatus Lee et al. 1978 emend. Juvonen e Suihko 2006 Pelosinus Shelobolina et al. 2007 Propionispira Schink et al. 1983 Propionispora Biebl et al. 2001 Psychrosinus ♠ Sattley et al. 2008 Quinella ♪ Krumholz et al. 1993 Schwartzia van Gylswyk et al. 1997 Selenomonas von Prowazek 1913 Sporolituus Ogg e Patel 2009 Sporomusa Möller et al. 1985 Thermosinus Sokolova et al. 2004 Veillonella Prévot 1933 emend. Mays et al. 1982 Zymophilus Schleifer et al. 1990

As Negativicutes são uma classe de bactérias Firmicutes, que possuem uma composição peculiar da sua parede celular que se tinge como gram-negativa, ao contrário da maioria das Firmicutes que são gram-positivas. As famílias Acidaminococcaceae e Veillonellaceae eram antes consideradas membros da classe Clostridia.[1] O nome Selenobacteria também é utilizado para referir-se a alguns membros deste grupo. A descrição deste grupo foi emendada em 2010 e, juntamente com as Acidaminococcaceae (família nova), foi colocada na ordem Selenomonadales (ordo novus, que seria a única ordem do grupo) na classe Negativicutes (classis novus) do filo Firmicutes.

Os membros desta família são todos anaeróbios obrigados, e aparecem em habitats como rios, lagos e intestinos de articulados. A sua forma pode variar desde esféricas, como Megasphaera e Veillonella, a bacilos curvados, como as selenomónadas. O género Selenomonas tem uma forma característica curva, com flagelos inseridos no seu lado côncavo, enquanto que a Sporomusa é semelhante, mas não móvel. Os seus nomes referem-se a esta morfologia distintiva, uma vez que selene significa lua, e musa significa banana.[2] Alguns membros do grupo podem formar endósporos.

A classificação do grupo é complicada, porque um exame mais detalhado de membros deste grupo indica que os membros deste clado (grupo Selenomonas-Megasphaera-Sporomusa) são na realidade Clostridia, o que poria em causa o estabelecimento da classe Negativicutes com a sua definição actual.[3]

Filogenia

A taxonomia aceite actualmente deste grupo basea-se na LPSN[4] e no NCBI[5] e foi elaborada baseando-se em dados do ARNr de 16S da LTP 111 do The All-Species Living Tree Project[6]

Acidaminococcaceae   Succinispira mobilis Janssen e O'Farrell 1999       Acidaminococcus Rogosa 1969 emend. Jumas-Bilak et al. 2007       Phascolarctobacterium faecium Del Dot et al. 1994 (type sp.)     Phascolarctobacterium succinatutens Watanabe et al. 2012     Succiniclasticum ruminis van Gylswyk 1995         Veillonellaceae   ?Anaerospora hongkongensis ♠ Woo et al. 2005     ?Desulfosporomusa polytropa ♠ Sass et al. 2004     ?Psychrosinus fermentans ♠ Sattley et al. 2008     ?Quinella ovalis ♪ Krumholz et al. 1993 (Quin’s Oval)     ?Sporotalea colonica ♠ Ezaki et al. 2008     Sporomusa Möller et al. 1985           Sporolituus thermophilus Ogg e Patel 2009     Thermosinus carboxydivorans Sokolova et al. 2004         Veillonella Prévot 1933 emend. Mays et al. 1982       Megasphaera [incl. Anaeroglobus geminatus]       Negativicoccus succinicivorans Marchandin et al. 2010     Dialister [incl. Allisonella histaminiformans]               Anaeromusa acidaminophila Baena et al. 1999     Anaeroarcus burkinensis (Ouattara et al. 1992) Strömpl et al. 1999           Acetonema longum Kane e Breznak 1992     Pelosinus Shelobolina et al. 2007         Propionispora Biebl et al. 2001       Dendrosporobacter quercicolus (Stankewich et al. 1971) Strömpl et al. 2000       Anaerosinus glycerini (Schauder e Schink 1996) Strömpl et al. 1999         Propionispira arboris Schink et al. 1983     Zymophilus Schleifer et al. 1990           Megamonas Shah e Collins 1983     Pectinatus Lee et al. 1978 emend. Juvonen e Suihko 2006         Anaerovibrio lipolyticus Hungate 1966     Selenomonas [incl. Schwartzia succinivorans, Centipeda periodontii & Mitsuokella]

Notas:

♠ Cepas que se encontram no NCBI, mas que não estão listadas na LPSN

♪ Procariotas em que não existem cultivos axénicos (puros) isolados ou disponíveis.

Referências

1. Morotomi M, Nagai F, Sakon H (2007). «Genus Megamonas should be placed in the lineage of Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; 'Acidaminococcaceae'; Megamonas». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57 (Pt 7): 1673–4. PMID 17625216. doi:10.1099/ijs.0.65150-0  !CS1 manut: Nomes múltiplos: lista de autores (link)^[ligação inativa]
2. Marchandin, H.; Teyssier, C.; Campos, J.; Jean-Pierre, H.; Roger, F.; Gay, B.; Carlier, J. -P.; Jumas-Bilak, E. (2009). "Negativicoccus succinicivorans gen. Nov., sp. Nov., isolated from human clinical samples, emended description of the family Veillonellaceae and description of Negativicutes classis nov., Selenomonadales ord. Nov. And Acidaminococcaceae fam. Nov. In the bacterial phylum Firmicutes". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 60 (6): 1271–1279. doi:10.1099/ijs.0.013102-0. PMID 19667386.
3. Yutin N, Galperin MY (2013) A genomic update on Clostridial phylogeny: Gram-negative spore formers and other misplaced Clostridia. Environ Microbiol doi: 10.1111/1462-2920.12173. PMID 23834245. [1]
4. J.P. Euzéby. «Negativicutes». List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Consultado em 20 de março de 2013. Arquivado do original em 27 de janeiro de 2013 
5. Sayers; et al. «Negativicutes». National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado em 20 de março de 2013 
6. All-Species Living Tree Project.«16S rRNA-based LTP release 111 (full tree)» (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Consultado em 20 de março de 2013