O Campeonato será disputado em dois turnos, da seguinte forma: Taça Cidade do Natal (1° turno) e Copa RN (2° turno).
A Taça Cidade do Natal será disputada em 03 Fases, Classificatória, Semi Final e Final. A fase classificatória será composta de nove rodadas, apenas com jogos de ida. Classifincando-se para a semi-final os quatro times, melhores colocados ao final da fase. A semi-final será disputada em partidas únicas (apenas jogo de ida), com o cruzmento do 1° x 4° e 2° x 3°, com o mando de campo dos 1° e 2° colocados. A final será disputada, em partida de ida e volta, com mando de campo da segunda partida para o time com melhor índice técnico, considerando o somatório das duas fases anteriores.
A Copa RN, será no mesmo formato de disputa da Taça Cidade do Natal.
A grande final do campeonato será disputado, entre os times campeões do 1° turno e 2° turno, em jogos de ida e volta, com vantagem para a agremiação que mais somou pontos, durante toda a competição.
A associação campeã da Taça Cidade do Natal e da Copa RN 2012 serão declaradas, automaticamente, representantes do Rio Grande do Norte na Copa do Brasil 2013. A equipe que vai respresentar o Rio Grande do Norte no Brasileiro da Série D, será o melhor rankiado na competição, sem contar com ABC e América, que já representam o futebol do RN no Brasileiro da Série B. Será rebaixada a equipe que ficar em 10° lugar na competição.
Critérios de desempate
Ocorrendo empate em números de pontos ganhos entre duas ou mais
agremiações em qualquer Fase ou Turno, serão aplicados os seguintes
critérios de desempate, pela ordem e sucessivamente, exclusivamente em cada Fase ou Turno:
Maior número de vitórias;
Maior saldo de gols;
Maior número de gols marcados;
Menor numero de cartões vermelhos recebidos
Menor número de cartões amarelos recebidos.
Sorteio público na sede da Federação, em dia e horário a serem determinados pela FNF.
Assim como em anos anteriores, a transmissão do Campeonato Potiguar deste ano foi exclusiva da TV União de Natal, disponível no sistema a Cabo na capital potiguar e em TV Aberta para algumas cidades do interior do Rio Grande Norte. Detalhe que a TV União de Natal também disponibiliza a transmissão pela internet, fazendo com que seus telespectadores pudessem assistir aos jogos também pelo computador.