Zeigers eerste sport was zwemmen. Tijdens haar studie aan de Brown Universiteit zwom ze records op de 500, 1000 en 1650 ydvrije slag. Deze records zette ze in 1991 neer, maar waren in 2005 nog altijd niet gebroken. Hardlopen en fietsen in competitieverband werd later aan haar sportrepertoire toegevoegd, in respectievelijk 1992 en 1993. In 1997 werd ze tiende op de Ironman Hawaï. Haar beste klassering bij deze wedstrijd behaalde ze in 2000 met een vijfde plaats.
In 2000 deed Joanna Zeiger mee aan de eerste triatlon op de Olympische Spelen van Sydney. Daar behaalde ze een vierde plaats met een tijd van 2:01.25,74. Deze wedstrijd werd gewonnen door de ZwitserseBrigitte McMahon in 2:00.40,52.