|
U4 snRNA
 U4 snRNA（U4 small nuclear RNA）は、メジャースプライソソーム（U2依存的スプライソソーム）のノンコーディングRNA構成要素である。スプライソソームは、真核生物のmRNA前駆体のスプライシングに関与する分子機械である。U4 snRNAはU6 snRNAと二重らせんを形成し、スプライシングのラウンドごとにATP依存的にU6 snRNA（そしてスプライソソーム）から除去される。U4 snRNAが除去されたU6 snRNAは再フォールディングし、スプライシングの触媒のための活性部位を形成する。U4のU6からの解離はBrr2によって行われ、U6との再アニーリングはPrp24によって行われる。U4の5'ステムループと結合タンパク質の複合体の結晶構造が解かれている[1]。 生物学的役割U4 snRNAは、タンパク質に結合したsnRNPとして[2]、U6 snRNAとともにdi-snRNPとして[3]、U6 snRNA、U5 snRNAともにtri-snRNPとして[4][5]など、多数の異なる形態で存在することが示されている。こうしたさまざまな形態は、penta-snRNPの活性におけるさまざまな一時的イベントに対応するものである[6]、またはスプライソソームの組み立てと活性の段階的モデルにおける中間体である[7]、といったことが提唱されている。 U4 snRNA（と酵母におけるアナログであると考えらえるsnR14[8]）は、スプライシング反応の特異的触媒活性に直接関与することは示されておらず[9]、U6 snRNAの調節因子として作用することが提唱されている。U4 snRNAは、2つの高度に保存されたステム領域でU6 snRNAと相補的塩基対を形成することにより、組み立て時にスプライソソームの活性を阻害する[10]。この塩基対形成は、U6 snRNAがU2 snRNAとともに触媒活性に必要なコンフォメーションへと組み立てられるのを防ぐことが示唆されている[11]。U4 snRNAが分解されてスプライソソームから除去された場合、スプライシングは効果的に停止される[12]。U4 snRNAとU6 snRNAはin vitroでのスプライシング反応に必要であることが示されている[13]。 構造  U4 snRNAの二次構造は、U6 snRNAとの相互作用に依存して変化することが示唆されている[7]。X線結晶構造解析[1][14]、NMR[15]、化学修飾によるRNA構造のプロービング[16]によるいくつかの研究からは、U4 snRNAの二次構造にはいくつかの保存されたモチーフが存在し[17]、構造的な役割とともに他のスプライシング要素との相互作用を確立する際の相互作用を仲介する役割も果たしていることが示されている。U4とU6が塩基対を形成した際の推定二次構造は多様な種間で保存されており、スプライシング装置の起源の古さが示唆される[18]。高度に保存されたKループ（kinked loop）は特異的なタンパク質相互作用に関与することが示されている[1][19]。 相互作用スプライソソームが活性状態となる前に、U4 snRNAはBrr2が関与するATP依存的過程によってU6 snRNAから除去されなければならない[9][20][21]。U4とU6の結合と解離のサイクルにはBrr2とPrp24の双方が関与していることが提唱されており、Prp24はU4をU6へ選択的に再アニーリングさせる[21][22][23][24]。U4 snRNAの3'末端近傍に位置する保存領域の周囲に結合するSmタンパク質のリングは、さまざまなsnRNPとの相互作用を促進するとともに、RNaseによる分解からU４ snRNAを保護している可能性が推定されている[25][26]。スプライソソーム経路には100以上のタンパク質が関与することが同定されており、さまざまなサイズのいくつかのタンパク質がU4 snRNPと相互作用することが知られている[27]。 出典
関連文献
外部リンク |
||||||||||||||||||||||
Index:
pl ar de en es fr it arz nl ja pt ceb sv uk vi war zh ru af ast az bg zh-min-nan bn be ca cs cy da et el eo eu fa gl ko hi hr id he ka la lv lt hu mk ms min no nn ce uz kk ro simple sk sl sr sh fi ta tt th tg azb tr ur zh-yue hy my ace als am an hyw ban bjn map-bms ba be-tarask bcl bpy bar bs br cv nv eml hif fo fy ga gd gu hak ha hsb io ig ilo ia ie os is jv kn ht ku ckb ky mrj lb lij li lmo mai mg ml zh-classical mr xmf mzn cdo mn nap new ne frr oc mhr or as pa pnb ps pms nds crh qu sa sah sco sq scn si sd szl su sw tl shn te bug vec vo wa wuu yi yo diq bat-smg zu lad kbd ang smn ab roa-rup frp arc gn av ay bh bi bo bxr cbk-zam co za dag ary se pdc dv dsb myv ext fur gv gag inh ki glk gan guw xal haw rw kbp pam csb kw km kv koi kg gom ks gcr lo lbe ltg lez nia ln jbo lg mt mi tw mwl mdf mnw nqo fj nah na nds-nl nrm nov om pi pag pap pfl pcd krc kaa ksh rm rue sm sat sc trv stq nso sn cu so srn kab roa-tara tet tpi to chr tum tk tyv udm ug vep fiu-vro vls wo xh zea ty ak bm ch ny ee ff got iu ik kl mad cr pih ami pwn pnt dz rmy rn sg st tn ss ti din chy ts kcg ve
Portal di Ensiklopedia Dunia
