ja Jmol

Jmol
	ストレプトアビジン表示例
開発元	Jmol development team
初版	2001年 (24年前)
リポジトリ	sourceforge.net/projects/jmol
プログラミング; 言語	Java
対応OS	Cross-platform
プラットフォーム	ウェブブラウザ及びJava
対応言語	16言語
	対応言語一覧カタロニア語、中国語、チェコ語、デンマーク語、オランダ語、英語、フランス語、ドイツ語、ハンガリー語、インドネシア語、イタリア語、韓国語、ポルトガル語、スペイン語、トルコ語、ウクライナ語
サポート状況	Active
種別	分子シミュレーション
ライセンス	LGPL 2.0
公式サイト	www.jmol.org
	テンプレートを表示

Jmolは化学や生化学分野の教育研究に用いられる^[2]、3次元コンピュータグラフィックスの分子シミュレーションソフトウェアである^[3]。Javaで組まれておりMicrosoft Windows、macOS、Linux、 UNIXで動作し、GNU Lesser General Public License Ver2.0で公開されたFLOSSである。スタンドアロン版及びソフトウェア開発キットは、BioclipseやTavernaなど他のJavaアプリケーションと統合できる。

人気の機能として、球棒モデル、空間充填モデル、リボンダイヤグラムなど様々に分子をウェブページに表示できる上^[4]、Protein Data Bank (pdb)、Crystallographic Information File (cif)、MDL Molfile (mol)、Chemical Markup Language (CML)など多様な化学ファイルフォーマットに対応している^[5]。Java不要でJavaScriptで動作するHTML5版のJSmol^[6]も利用できる。

脚注

外部リンク

公式ウェブサイト

[launchpad-1] Jmol translations

[Herraez2006-2] Herráez, A (2006), “Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue”, Biochemistry and Molecular Biology Education 34 (4): 7, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644

[Chen2008-3] Chen, Jim X. (2008), Springer, ed., Guide to Graphics Software Tools, p. 471, ISBN 978-1-84800-900-4

[Herraez2007-4] Herráez, A (2007), Lulu, ed., How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, p. 21, ISBN 978-1-84799-259-8

[Willighagen2001-5] Willighagen, E (2001), “Processing CML conventions in Java”, Internet Journal of Chemistry 4 (4): 1–9 ^{[リンク切れ]}

[6] “JSmol”. 2015年11月2日閲覧。

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]