スフィンゴビウム属

スフィンゴビウム属
寒天培地上のスフィンゴビウム・クロロフェノリカム（Sphingobium chlorophenolicum）のコロニー
分類
ドメイン : 真正細菌 Bacteria 門 : プロテオバクテリア門 Pseudomonadota 綱 : アルファプロテオバクテリア綱 Alphaproteobacteria 目 : スフィンゴモナス目 Sphingomonadales 科 : スフィンゴモナス科 Sphingomonadaceae 属 : スフィンゴビウム属 Sphingobium
学名
Sphingobium Takeuchi et al. 2001[1] (IJSEMリストに掲載 2001[2]
タイプ種
スフィンゴビウム・ヤノイクエ Sphingobium yanoikuyae (Yabuuchi et al. 1990[3]) Takeuchi et al. 2001[1]
下位分類（種）
Sphingobium abikonense abikonense Kumari et al. 2009 Sphingobium agri Huq et al. 2023 Sphingobium algorifonticola Chen et al. 2020 Sphingobium amiense Ushiba et al. 2003 Sphingobium aquiterrae Révész et al. 2018 Sphingobium aromaticiconvertens Wittich et al. 2007 Sphingobium baderi Kaur et al. 2013 Sphingobium bisphenolivorans Qin et al. 2020 Sphingobium boeckii Chen et al. 2013 スフィンゴビウム・クロロフェノリカム Sphingobium chlorophenolicum (Nohynek et al. 1996) Takeuchi et al. 2001 Sphingobium chungbukense (Kim et al. 2000) Pal et al. 2005 スフィンゴビウム・クロアカ Sphingobium cloacae (Fujii et al. 2001) Prakash and Lal 2006 Sphingobium cupriresistens Li et al. 2013 Sphingobium endophyticum corrig. Zhu et al. 2015 Sphingobium estronivorans Qin et al. 2020 Sphingobium faniae Guo et al. 2010 Sphingobium fluviale Sheu et al. 2020 Sphingobium fontiphilum Sheu et al. 2013 Sphingobium fuliginis Prakash and Lal 2006 Sphingobium herbicidovorans (Zipper et al. 1997) Takeuchi et al. 2001 Sphingobium indicum Pal et al. 2005 Sphingobium jiangsuense Zhang et al. 2012 Sphingobium lactosutens Kumari et al. 2009 Sphingobium lignivorans Allemann et al. 2023 Sphingobium limneticum Chen et al. 2013 Sphingobium mellinum Francis et al. 2014 Sphingobium naphthae Chaudhary et al. 2017 Sphingobium nicotianae Fan et al. 2023 Sphingobium olei Young et al. 2007 Sphingobium phenoxybenzoativorans Cai et al. 2015 Sphingobium pinisoli Lee et al. 2019 Sphingobium psychrophilum Dahal et al. 2021 Sphingobium qiguonii Yan et al. 2010 Sphingobium quisquiliarum Bala et al. 2010 Sphingobium rhizovicinum Young et al. 2008 Sphingobium scionense Liang and Lloyd-Jones 2010 Sphingobium subterraneum Lee et al. 2015 Sphingobium sufflavum Sheu et al. 2013 Sphingobium terrigena Park et al. 2019 Sphingobium ummariense Singh and Lal 2009 Sphingobium vermicomposti Vaz-Moreira et al. 2009 Sphingobium vulgare Baek et al. 2010 Sphingobium wenxiniae Wang et al. 2011 Sphingobium xanthum Francis et al. 2014 Sphingobium xenophagum (Stolz et al. 2000) Pal et al. 2006 スフィンゴビウム・ヤノイクエ Sphingobium yanoikuyae (Yabuuchi et al. 1990[3]) Takeuchi et al. 2001[1]

 

スフィンゴビウム属（ーぞく、Sphingobium）は真正細菌プロテオバクテリア門アルファプロテオバクテリア綱スフィンゴモナス目スフィンゴモナス科の属の一つである。

概要

学名は、ギリシャ語で「生命」「生物」を意味する名詞"bios"由来の形容詞"bium"を用いて、「スフィンゴシンを含む生物」を意味する新ラテン語の女性名詞となる。

グラム陰性の非胞子形成桿菌であり、細胞のサイズは0.3～0.7×1.0～3.5μmである。運動性と非運動性のどちらも存在する。コロニーは黄色又は白褐色である。偏性好気性且つ化学有機栄養性である[1]。ほとんどの種はカタラーゼ陽性及び硝酸還元陰性を示す[4]。主要なユビキノンはQ-10である。主要な脂肪酸は18:1であり、16:0は少量検出される。主要な2-ヒドロキシ脂肪酸は2-OH 14:0である。主要なポリアミン成分はスペルミジンである[1]。主要な極性脂質は、いくつかの例外を除いて、ジホスファチジルグリセロール(DPG)、ホスファチジルエタノールアミン(PE)、ホスファチジルモノメチルエタノールアミン(PG)、及びスフィンゴ糖脂質(SGL)である。ホスファチジルグリセロール(PME)、ホスファチジルジメチルエタノールアミン(PDE)、ホスファチジルコリン(PC)も見られる。DNAのGC含量は59～67mol%である[4]。特徴的な16S rRNAシグネイチャー配列は、位置52:359(U:A)、134(G)、593(U)、987:1218(A:U)及び990:1215(U:G)に存在する。土壌、ペンタクロロフェノール汚染土壌及び臨床検体から単離される[1]。

芳香族や塩化芳香族化合物、ノニルフェノールやペンタクロロフェノールといったフェノール化合物、(RS)-2-(4-クロロ-2-メチルフェノキシ)プロピオン酸やベンゼンヘキサクロリドなどの除草剤成分、多環芳香族炭化水素など、環境中のさまざまな化学物質を分解する。

脚注

1. ^ M Takeuchi, K Hamana and A Hiraishi (01 July 2001). “Proposal of the genus Sphingomonas sensu stricto and three new genera, Sphingobium, Novosphingobium and Sphingopyxis, on the basis of phylogenetic and chemotaxonomic analyses”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 (4): 1405-17. doi:10.1099/00207713-51-4-1405. PMID 11491340. 
2. “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 51, part 4, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 (5). (01 September 2001). doi:10.1099/00207713-51-5-1621. 
3. ^ Eiko Yabuuchi, Ikuya Yano, Hiroshi Oyaizu, Yasuhiro Hashimoto, Takayuki Ezaki, Hiroyuki Yamamoto (February 1990). “Proposals of Sphingomonas paucimobilis gen. nov. and comb. nov., Sphingomonas parapaucimobilis sp. nov., Sphingomonas yanoikuyae sp. nov., Sphingomonas adhaesiva sp. nov., Sphingomonas capsulata comb, nov., and Two Genospecies of the Genus Sphingomonas”. Microbiology and Immunology (2): 99-119. doi:10.1111/j.1348-0421.1990.tb00996.x. PMID 2111872. 
4. ^ Liqiong Li, Hongliang Liu, Zunji Shi and Gejiao Wang (01 February 2013). “Sphingobium cupriresistens sp. nov., a copper-resistant bacterium isolated from copper mine soil, and emended description of the genus Sphingobium”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 63 (Pt_2): 604-609. doi:10.1099/ijs.0.040865-0.