Il primo lavoro di Jae Lee per Marvel Comics fu una serie di fumetti su Bestia presente in Marvel Comics Presents #85-92 (1991). Salì alla ribalta in questo settore nel 1992 per il suo lavoro in Namor, subendrando a John Byrne, il quale continuò la serie come scrittore. Terry Kavanagh, editore di Lee in "Marvel Comics Presents" e "Namor", in seguito disse che assegnò "Namor" a Lee perché a lui piaceva il suo stile e sentiva che, come nuovo artista, avrebbe beneficiato del lavoro di uno scrittore d'esperienza. Lee continuò fin quando Bob Harras diventò il nuovo scrittore, disegnando #26-38 (Maggio 1992-Maggio 1993). Come disegnatore di "X-Factor", Lee fu uno degli artisti in Execuzione, storia che intercorre attraverso le storie degli X-Men nel 1992.[1] L'anno seguente, Lee disegnò le tre storie "Youngblood" per "Extreme Studios" di Rob Liefeld (Image Comics) e tre storie Wildcats per WildStorm di Jim Lee. Nel 1994, Jae Lee produsse una serie di Image Comics creati da se stesso, "Hellshock", una storia su un angelo caduto che lui scrisse e illustrò.
Nel 1998, Lee e lo scrittore Paul Jenkins crearono una serie limitata "Inumani",[2] grazie al quale vinsero il "Eisner Award per la migliore nuova serie" nel 1999.[3] Si riunirono, più tardi, per Sentry.[4] Lee e lo scrittore Grant Morrison produssero la miniserie Fantastici Quattro (Ottobre 2001- Febbraio 2002), il quale diede a Lee la nomination all Eisner Award del 2002 come Miglior disegnatore di copertina. Nel 2003, Lee, lo scrittore John Ney Reiber, e la moglie di Lee, June Chong, produssero una miniserie per Dreamwave Productions "Transformers/G.I. Joe, ambientata in un secondo dopoguerra alternativo.
A partire dal 2007, Lee lavorò con l'artista Richard Isanove e lo scrittore Robin Furth e Peter David sulla serie di fumetti Marvel "Dark Tower", basate sul libero di Stephen King "La torre nera". Lee disegnò le prime tre miniserie di quella serie, La nascita del pistolero, La lunga via del ritorno e Tradimento. Ritornò per il quinto libro della serie, "Battle of Jericho Hill". Ha provveduto alla realizzazione della copertina dell'ottava edizione di "La torre nera" per Donald M. Grant, "The wind throught the keyhole, il quale fu pubblicato il 21 Febbraio 2012.
^ Matthew K. Manning e Laura, ed. Gilbert, 1990s, in Marvel Chronicle A Year by Year History, London, United Kingdom, Dorling Kindersley, 2008, p. 261, ISBN978-0-7566-4123-8.
«"The 'X-Cutioner's Song' [was] an epic twelve-part crossover showcasing the various X-teams' battle with the Cable-clone Stryfe."»
^Manning "1990s" in Gilbert (2008), p. 290: "In this twelve-issue Marvel Knights limited series, writer Paul Jenkins and artist Jae Lee put a realistic face on the denizens of the mystical city of Attilan."
^ Matthew K. Manning e Alastair, ed. Dougall, 2010s, in Batman: A Visual History, London, United Kingdom, Dorling Kindersley, 2014, p. 337, ISBN978-1-4654-2456-3.
«How that team-up [of Batman and Superman] began remained a mystery. Writer Greg Pak and artists Jae Lee and Ben Oliver decided to fill in that gap.»
^2002 Will Eisner Comic Industry Awards, su hahnlibrary.net, Hahn Library Comic Book Awards Almanac. URL consultato il 21 febbraio 2013 (archiviato dall'url originale il 22 settembre 2013).
