Gephi è stato usato in una serie di progetti di ricerca in ambito universitario, giornalistico e in vari altri campi, per esempio per visualizzare le connessioni globali ai contenuti del 'New York Times[4] o per esaminare la rete di traffico su Twitter in occasioni di disordini sociali[5][6], ma anche per altre tematiche solitamente oggetto di analisi di rete [7]
Il "Gephi Consortium" è una società francese non-profit che supporta la continuità dello sviluppo del software Gephi. Tra i membri ci sono Sciences Po, Linkfluence, WebAtlas, e Quid.[8]
Gephi ha ispirato il servizio InMaps[9] di LinkedIn ed è stato usato nelle analisi e visualizzazioni di rete per Truthy.[10]
Alcuni esempi di utilizzo nel data journalism in Italia
Nel settore del data journalism in Italia, Gephi comincia ad essere utilizzato per la visualizzazione delle reti, tra i quali l'analisi del debito sovrano tra gli stati, l'analisi delle relazioni professionali dei protagonisti del film di Paolo Sorrentino "La Grande Bellezza" e le relazioni tra gli utenti twitter che hanno seguito il festival del giornalismo Glocal organizzato a Varese.
^The Gephi Consortium - Members, su consortium.gephi.org, The Gephi Consortium. URL consultato il 23 novembre 2011 (archiviato dall'url originale il 7 novembre 2011).