Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti il Futbol'nyj Klub Zenit Sankt-Peterburg nelle competizioni ufficiali della stagione 2012-2013.
Stagione
Dopo la vittoria nella precedente stagione, la squadra non riuscì a ripetersi, finendo seconda alle spalle del CSKA Mosca.
In Coppa, dopo aver eliminato Baltika (2-1 in trasferta), Mordovija (2-0, sempre in trasferta) e Kuban' (4-3 ai rigori, stavolta in casa), fu eliminato dall'Anži in semifinale (sconfitta casalinga per 1-0).
In Champions, qualificata direttamente alla fase a gironi, finì terzo nel Girone C dietro Malaga e Milan, retrocedendo in Europa League.
In quest'ultima competizione pescò subito il Liverpool: ebbe ragione degli inglesi grazie alla regola dei gol fuori casa (vittoria 2-0 in casa, sconfitta 3-1 in trasferta), ma agli ottavi fu eliminato dagli svizzeri del Basilea (sconfitta 2-0 fuori casa e vittoria 1-0 in casa).
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