Quella che era iniziata come una semplice indagine per omicidio su una proprietà federale a New York City si è trasformata in una caccia all'uomo. L'ufficio di New York chiede l'aiuto dell'International Fly Team con sede a Budapest dopo aver scoperto che il loro fuggitivo è scappato in Europa.
Una giovane madre fugge in Ungheria con il figlio dopo aver perso la custodia congiunta negli Stati Uniti; dopo che il ragazzo viene rapito in pieno giorno a Budapest, il team si chiede quale genitore sia il pericolo nella vita del bambino.
La squadra indaga su una rapina che si è conclusa con l'omicidio di un trasportatore americano. Durante l'indagine Kellett viene ferita e Forrester vuole scoprire la verità.
La squadra indaga su un cittadino americano che si proclama innocente dopo aver cercato rifugio presso l'ambasciata americana di Madrid mentre era ancora coperto dal sangue del suo fidanzato spagnolo assassinato.
La squadra indaga sulla morte per avvelenamento di un giornalista americano dopo il suo tentativo di incontrare una fonte anonima in Polonia. Inoltre, Kellett accusa Forrester di essere iperprotettivo con lei durante la missione.
Una negoziatrice dell'intelligence statunitense scompare e si scopre che il suo appartamento a Parigi è coperto del suo sangue. La squadra deve trovarla prima che i segreti nucleari del paese cadano nelle mani sbagliate. Inoltre, Forrester si ritrova a tracciare alcuni parallelismi con la scomparsa di sua madre.
Il fondatore americano di un sito illegale per soli adulti viene ucciso a Praga. Il team ha il compito di localizzare il suo socio che è in fuga nella Repubblica Ceca. Inoltre, Kellett fatica a mantenere una relazione con sua madre a causa delle complicazioni del lavoro che la portano lontana da casa.
Una comitiva di americani è tra le vittime di un attentato a un festival a Budapest. La squadra viene coinvolta per trovare gli autori prima che colpiscano di nuovo. Inoltre, quando il nuovo fidanzato di Vo viene ferito nell'esplosione, lei valuta cosa significa veramente uscire insieme con un agente.
Un gruppo di terroristi albanesi fa irruzione in un teatro di Sofia, in Bulgaria, e tiene in ostaggio il pubblico e gli artisti tra cui ci sono studenti statunitensi. Chiedono un riscatto in criptovaluta in cambio del loro rilascio. Il Fly Team dibatte in modo molto acceso con il commissario bulgaro che insiste per pompare un gas velenoso tramite il sistema di aria condizionata e fare irruzione nel teatro seguendo il modello russo durante la crisi del teatro Dubrovka. Inoltre, Raines è intenzionato a dimostrare le sue abilità sul campo e Forrester riceve notizie su Tank.
Il Fly Team si unisce, con riluttanza, a un'indagine nell'Irlanda del Nord. Uno degli informatori preziosi di Kellett viene arrestato per il suo legame con una rapina e un omicidio. Kellet deve aiutarlo a riabilitare il suo nome.
Quando un agente della polizia di New York viene arrestato in Transnistria per aggressione aggravata, la squadra indaga su un giro di traffico sessuale. Inoltre, Forrester riceve un messaggio insolito da un mittente sconosciuto.
Mentre Jamie e Scott cercano di "frenare" la loro relazione, Scott arriva a un bivio quando incontra sua madre, traditrice degli USA, che afferma di lavorare come agente doppiogiochista per la CIA. Allo stesso tempo, un famigerato magnate della tecnologia americano viene coinvolto in un omicidio a Francoforte. Il Fly Team deve inseguirlo tra i manifestanti locali che ha incitato con le sue teorie del complotto sui social media. Tale caccia all'uomo ricorda vagamente il caso dell'arresto di John McAfee in Spagna nell'ottobre 2020. Inoltre, a Jaeger piace lavorare nel suo paese d'origine.
Quando una coppia fugge in Albania in attesa della condanna per aver rubato milioni di dollari in fondi di soccorso COVID dal governo degli Stati Uniti, il Fly Team e Jaeger devono fare i conti con la minacciosa famiglia criminale della moglie mentre cercano di rintracciare i due. Inoltre, Kellett lavora al caso da Budapest mentre lei e Forrester cercano di riconquistare i loro spazi professionali.
Il Fly Team deve capire come tenere al sicuro il procuratore generale degli Stati Uniti in una possibile violazione della sicurezza mentre è in Ungheria per un incontro importante. Inoltre, la sorella di Raines è a Budapest.
Quando la sorella di Raines scompare in Kosovo, lui va a cercarla, mettendo a rischio il suo lavoro e la sua vita. Inoltre, Kellett e Forrester devono affrontare un ulteriore esame dall'interno del Bureau.
Quando un viticoltore americano viene ucciso a colpi di arma da fuoco nella sua tenuta in Occitania, il Fly Team deve determinare se la colpa è di un gruppo di protesta locale della regione con una storia di violenze contro gli stranieri.
A seguito di un attacco da parte di uomini armati a bordo di una nave da crociera fluviale di proprietà americana sul Danubio, il Fly Team si dirige a Vienna per indagare sul motivo per cui la barca è stata presa di mira. Inoltre, Forrester si rende conto che i suoi sentimenti di sfiducia causati dal suo passato stanno influenzando le sue relazioni personali.
Uno scienziato insoddisfatto approfitta della rabbia di un soldato verso le misure di contenimento della pandemia da COVID-19 per istigarlo a uccidere alcuni medici che ostacolano le sue idee innovative. Il Fly Team deve quindi catturare il cecchino che ha aperto il fuoco su un laboratorio biomedico in Belgio lasciando dei feriti e un biologo molecolare americano morto. Inoltre, Jaeger si scontra con il suo capo all'Europol a causa della sua lealtà al Fly Team, e alla fine viene da lui rimossa dall'incarico.
Il Fly Team e Jaeger si dirigono a Berlino dopo che un artista diciannovenne, figlio di un miliardario americano, viene trovato privo di sensi nel suo appartamento per overdose da ossicodone e fentanyl. Il padre sfrutta la propria influenza per coinvolgere l'FBI nelle indagini e scoprire chi gli ha venduto la droga, ma Forrester e i colleghi vengono intralciati da un gruppo di investigatori privati assunti sempre dal padre, che si rifiutano di condividere informazioni.
Quando un jet privato che trasporta cittadini americani viene abbattuto in Polonia, il Fly Team indaga sull'unico uomo che ha perso il volo. Inoltre, la madre di Forrester gli chiede aiuto per portare in salvo un alto esponente del Cremlino (che si rivela essere il passeggero rimasto a terra ed è nascosto in Croazia) deciso a tradire il proprio Paese e a chiedere asilo negli Stati Uniti, mettendo il figlio e di conseguenza la squadra in una posizione difficile. Alla fine Scott scopre che la madre è sempre stata "leale" verso gli USA, facendo quindi il doppio gioco per la Russia. Katrin è stata promossa a capo della sede Europol dell'intera Europa Centrale, e l'episodio si conclude con una piccola festa d'addio in un locale di Budapest, in cui ciascuno racconta i propri aneddoti su di lei e poi fanno un brindisi.