La DFB-Pokal 2008-2009 è stata la 66ª edizione della Coppa di Germania, è iniziata il 7 agosto 2008 e si è conclusa il 30 maggio 2009 con la vittoria del Werder Brema.
In seguito a una decisione del 2006[1], da questa edizione le squadre di riserve dei club professionistici non sono ammessi più alla competizione.
NOTA: In parentesi è riportato il risultato del primo tempo.