Nato a Yeovil, nel Somerset, figlio di un ingegnere e di una fisioterapista, Christopher Wheeldon ha cominciato a studiare danza all'età di otto anni, prima di specializzarsi alla Royal Ballet School tra gli undici e i diciotto anni. Nel 1991 si unì al Royal Ballet e nello stesso anno vinse il Prix de Lausanne. Nel 1993, all'età di diciannove anni, si trasferì a New York dove si unì al New York City Ballet, in cui fu promosso solista nel 1998. Due anni dopo terminò di esibirsi come ballerino per dedicarsi esclusivamente all'attività di coreografo, intrapresa nel 1997.[1]
Tra il 2001 e il 2008 fu il coreografo residente del New York City Ballet, per la quale coreografò numerosi balletti di grande successo di critica e pubblico. In parallelo all'attività a New York, Wheeldon coreografò opere per altre compagnie, tra cui il Royal Ballet, il San Francisco Ballet e il Balletto Bol'šoj. Nel 2006 ha fondato una propria compagnia, la Morphoses/The Wheeldon Company, che si è affermata su entrambe le sponde dell'Atlantico con frequenti rappresentazioni al New York City Center e al Sadler's Wells di Londra.[2]