La costruzione viene citata per la prima volta in documenti storici risalenti al 735, anche se venne successivamente sostanzialmente rimaneggiata. Nel 1780[2] l'originario edificio a tre navate venne sostituito da una nuova costruzione progettata da Antonio Boffa[3] . La consacrazione avvenne nel 1829.
Sulla cantoria in controfacciata si trova l'organo a canneMascioniopus 379,[4] costruito nel 1926 e restaurato dalla ditta costruttrice nel 2009. Lo strumento, la cui consolle ha due tastiere di 58 note e una pedaliera di 27, è a trasmissione elettropneumatica.
^La data è riportata dalla Guida d'arte della Svizzera italiana del 2007, ma altre fonti riportano il 1760, tuttavia sembra strano che dal 1760 al 1829 il comune sia rimasto per 70 anni senza chiesa consacrata.
^Agno, SS. Giovanni e Provino, su orgeldokumentationszentrum.ch. URL consultato il 5 maggio 2021 (archiviato dall'url originale il 30 luglio 2013).
Bibliografia
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Giovanni Maria Staffieri, "Agno", in Malcantone. Testimonianze culturali nei comuni malcantonesi, Lugano-Agno 1985, 16-21.