Il Campionato Nazionale Dilettanti 1958-1959 è stato il V livello del campionato italiano. A carattere regionale, fu il secondo campionato dilettantistico con questo nome, e il settimo se si considera che alla Promozione fu cambiato il nome assegnandogli questo.
Questi sono i gironi organizzati dalla Lega Regionale Ligure.
Nuova Sampierdarenese e Pertinace, retrocesse in Seconda Categoria, sono state tutte riammesse per allargamento dei quadri la stagione successiva.
Girone finale
Imperia campione dei dilettanti liguri è promossa in Serie D 1959-1960.
Note
In questa stagione a parità di punteggio non era prevista alcuna discriminante: le squadre a pari punti erano classificate a pari merito. In caso di assegnazione di un titolo sportivo era previsto uno spareggio in campo neutro.
^La Sestrese si fonde con l'Andrea Doria 1955, squadra di Serie D, in realtà un camuffamento della Corniglianese.