Alfonso Dionisio era figlio illegittimo del re Alfonso III del Portogallo e di Marina Peres di Enxara, come affermato in un documento del 1278 con il quale donò un feudo a Vila Pouca nel distretto di Torres Vedras.[1]. Sua madre era probabilmente originaria di Enxara, situata nelle vicinanza di Mafra. Sposò Maria Pais Ribeira, che, a causa della morte dei suoi fratelli senza eredi, divenne la quindicesima dama ed erede della Casa di Sousa e quella di Aboim.
Da questo matrimonio sono nati i seguenti figli:
Pedro Alfonso de Sousa, un uomo ricco alla corte di suo cugino re Alfonso IV del Portogallo, sposò Elvira Anes da Nóvoa;
Rodrigo Alfonso de Sousa, signore di Arraiolos e Pavia, sposato con Violante Ponço Briteiros;
Diogo Alfonso de Sousa (m. 13 novembre 1344) signore di Mafra ed Ericeira, sposato con Violante Lopes Pacheco;
García Mendes de Sousa, priore di Santa María da Alcáçovas a Santarén;
Gonzalo Mendes de Sousa, non si sa se si sia sposato o abbia avuto figli.
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