ZooBank

Histoire
Fondation	2006
Type	Site web, base de données en ligne, base de données biologiques
Fondateur	Richard Lawrence Pyle (en)
Organisation mère	Commission internationale de nomenclature zoologique
Site web	(en) zoobank.org

ZooBank est un site web en libre accès destiné à devenir le registre officiel de la Commission internationale de nomenclature zoologique (ICZN)^[3]. Tout acte de nomenclature (par exemple, les publications qui créent ou modifient un nom taxinomique) doit être enregistré auprès de ZooBank pour être reconnu « officiellement » par le Code international de nomenclature zoologique.

Les Life Science Identifiers (en) (« identifiants des sciences de la vie », LSID) sont uniques au monde pour chaque entrée d'enregistrement de ZooBank^[4].

Le prototype de ZooBank a été ensemencé avec des données provenant de l'Index to Organism Names^[5], qui a été compilé à partir de la littérature scientifique dans le Zoological Record (en), maintenant propriété de Thomson Reuters.

Le site est consultable dans onze langues différentes dont le français.

Histoire

ZooBank a été officiellement proposée en 2005 par le secrétaire exécutif de l'ICZN^[6]^,^[7]. Le registre a été mis en ligne le 10 août 2006 avec 1,5 million d'espèces inscrites^[8]^,^[9].

Les premiers LSID de ZooBank ont été émis le 1^er janvier 2008^[4], précisément 250 ans après le 1^er janvier 1758, qui est la date définie par le code ICZN comme le début officiel de la nomenclature zoologique scientifique. Chromis abyssus a été la première espèce entrée dans le système ZooBank avec un horodatage de 2008-01-01T00:00:02^[10]^,^[11].

Contenu

Quatre types principaux d'objets de données sont collectés dans la ZooBank. Nomenclatural acts, les « actes nomenclaturaux », sont régis par le code de nomenclature ICZN, et sont typiquement des descriptions originales de nouveaux noms scientifiques, cependant d'autres actes, tels que les émendations et les lectotypifications, sont également régis par le code ICZN et nécessitent techniquement un enregistrement par la ZooBank. Publications comprend les articles de journaux et autres publications contenant des actes nomenclaturaux. Authors enregistre les auteurs académiques des actes nomenclaturaux. Type Specimens enregistre les spécimens types des animaux qui sont provisoirement enregistrés, jusqu'à ce que les organismes responsables de ces types mettent en place leurs propres registres.

En outre, les périodiques qui ont publié des articles sont également des entités du système, donnant accès à une liste des « actes nomenclaturaux » publiés dans le périodique au fil du temps.

Publications électroniques

Traditionnellement, les données taxinomiques étaient publiées dans des revues ou des livres. Cependant, avec l'augmentation des publications électroniques, l'ICZN a établi de nouvelles règles qui incluent les publications électroniques, en particulier les publications uniquement électroniques. Ces publications sont désormais réglementées par des amendements aux articles 8, 9, 10, 21 et 78 de l'ICZN. Techniquement, les actes de nomenclature qui sont publiés dans des articles uniquement électroniques ne sont pas reconnus s'ils n'ont pas été enregistrés dans la ZooBank et sont alors considérés comme « inexistants »^[12]^,^[13].

Notes et références

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « ZooBank » (voir la liste des auteurs).

↑ (en) Eric N Rittmeyer, Allen Allison, Michael C Gründler, Derrick K Thompson, Christopher C Austin et William Etges (dir.), « Ecological guild evolution and the discovery of the world's smallest vertebrate », PLOS One, PLoS, vol. 7, n^o 1,‎ 11 janvier 2012, e29797 (ISSN 1932-6203, OCLC 228234657, PMID 22253785, PMCID 3256195, DOI 10.1371/JOURNAL.PONE.0029797).
↑ (en) « Paedophryne amauensis Rittmeyer, Allison, Gründler, Thompson & Austin, 2012 », sur zoobank.org (consulté le 9 août 2018)
↑ (en) Chillingworth, Mark, « Zoologists bank on database », Information World Review,‎ 10 avril 2006 (lire en ligne [archive du 12 avril 2006])
↑ ^{a et b} (en) Richard L. Pyle et Ellinor Michel, « ZooBank: Developing a nomenclatural tool for unifying 250 years of biological information », Zootaxa, vol. 1950, n^o 1,‎ 5 décembre 2008, p. 39–50 (ISSN 1175-5334 et 1175-5326, DOI 10.11646/zootaxa.1950.1.6, lire en ligne [PDF], consulté le 24 avril 2022)
↑ (en-GB) Clarivate Analytics, « ION: Index to Organism Names », sur www.organismnames.com (consulté le 24 avril 2022)
↑ (en) Andrew Polaszek, « A universal register for animal names », Nature, NPG et Springer Science+Business Media, vol. 437, n^o 7058,‎ 1^er septembre 2005, p. 477 (ISSN 1476-4687 et 0028-0836, OCLC 01586310, PMID 16177765, DOI 10.1038/437477A).
↑ (en-US) Carol Kaesuk Yoon, « In the Classification Kingdom, Only the Fittest Survive », sur The New York Times, 11 octobre 2005 (ISSN 0362-4331, consulté le 24 avril 2022)
↑ (en-US) « 60 Seconds : Zoo surfing », sur New Scientist (consulté le 24 avril 2022)
↑ (en-US) Lee Hotz, « Biodiverse MySpace? Online Encyclopedia To Name All Species », sur Wall Street Journal, 25 mai 2007 (ISSN 0099-9660, consulté le 24 avril 2022)
↑ (en) Live Science Staff published, « Pea-Sized Seahorse Makes 'Top 10 Species' List », sur livescience.com, 22 mai 2009 (consulté le 24 avril 2022)
↑ (en) « Chromis abyssus Pyle, Earle & Greene, 2008 », sur www.zoobank.org (consulté le 24 avril 2022)
↑ (en) International Commission on Zoological Nomenclature, « Amendment of Articles 8, 9, 10, 21 and 78 of the International Code of Zoological Nomenclature to expand and refine methods of publication », ZooKeys, vol. 219,‎ 4 septembre 2012, p. 1–10 (ISSN 1313-2970 et 1313-2989, DOI 10.3897/zookeys.219.3944, lire en ligne, consulté le 24 avril 2022)
↑ (en) « The Code Online | International Commission on Zoological Nomenclature », sur www.iczn.org (consulté le 2 octobre 2016)