À l'issue de la saison 2020-2021, durant laquelle il s'est installé comme le titulaire indiscutable au poste de pilier droit dans son club[12], il est appelé en équipe de France le , pour la tournée en Australie, au sein d'un groupe largement remanié[13]. Il connaît sa première cape le lors du deuxième match de la tournée, face à l'Australie. Il est titulaire en première ligne accompagné par Jean-Baptiste Gros et son coéquipier Gaëtan Barlot, et les Bleus l'emportent sur le score de 26 à 28[14].
Durant la saison 2021-2022, il est toujours le numéro un à droite de la mêlée castraise devant Levan Chilachava et Antoine Guillamon[12]. Son club termine à la première place de la phase régulière et se qualifie donc pour les phases finales de Top 14. Lors de la demi-finale, il est titulaire en première ligne aux côtés de Quentin Walcker et Gaëtan Barlot, et bat le Stade toulousain, se qualifiant ainsi pour la finale[15]. Le , il est de nouveau titulaire lors de la finale du Top 14 mais son équipe s'incline face au Montpellier HR (défaite 29 à 10)[16]. Cette saison, il joue 27 matchs toutes compétitions confondues et inscrit quatre essais, soit vingt points.
Pour la saison 2022-2023, Hounkpatin est toujours le titulaire à son poste dans le XV de départ du CO, devant Chilachava et Aurélien Azar qui arrive en provenance de Carcassonne[17].
En , il est libéré de ses deux années de contrat restantes avec Castres, et rejoint le Montpellier HR pour un contrat de trois saisons[18],[19].
Affaire judiciaire
Le CO met à pied le pilier Wilfrid Hounkpatin, mis en examen puis libéré, à la suite d'une plainte de son épouse pour violences conjugales le 10 janvier 2024[20]. Il est néanmoins à nouveau titularisé par le CO lors du derby contre le Stade toulousain en mars 2024. Puis, il est présenté devant un juge en avril et condamné à douze mois de prison avec sursis. Alors qu'il était dans le groupe du CO pour affronter l'équipe anglaise de Gloucester, en huitièmes de finale de challenge cup, Wilfried Houkpatin en est écarté.
Statistiques
En club
Statistiques en club de Wilfrid Hounkpatin (au 19 janvier 2023)